مقایسه تکنولوژی دستگاه های سکانس Illumina و Ion Torrent

دستگاه‌های سکانس‌ DNA نقش بسیار مهمی در پیشرفت علم ژنتیک و بیولوژی مولکولی ایفا می‌کنند. این دستگاه‌ها به ما اجازه می‌دهند که توالی‌های DNA را با دقت بالا و به صورت سریع تعیین کنیم، که این امر کاربردهای بسیاری در تحقیقات علمی، پزشکی، کشاورزی و زمینه‌های دیگر دارد. در اینجا به بررسی کلی دستگاه‌های سکانس‌دهی و تکنولوژی‌های مختلف آن‌ها می‌پردازیم:

انواع تکنولوژی‌های سکانس‌

سکانس‌ سنگر (Sanger Sequencing)

توضیح: روش سکانس‌دهی که توسط فردریک سنگر در دهه 1970 توسعه یافت. این روش از دی‌دئوکسی‌نوکلئوتیدهای نشاندار فلورسنت استفاده می‌کند که باعث قطع زنجیره DNA می‌شود. ویژگی‌ها: دقت بالا، اما زمان‌بر و پرهزینه است و فقط می‌تواند قطعات کوتاه DNA را سکانس دهد. کاربردها: مناسب برای پروژه‌های کوچک‌تر و تأیید نتایج سکانس‌ نسل بعدی (NGS).

***برای مطالعه بیشتر کلیک کنید***

سکانس‌ نسل بعدی (Next-Generation Sequencing – NGS)

 روش‌های مختلفی که توانایی تولید داده‌های سکانس‌دهی با بازدهی بالا را دارند. ویژگی‌ها: قابلیت تولید حجم بالایی از داده‌ها با هزینه کمتر در مقایسه با سکانس‌ سنتی. کاربردها: پروژه‌های بزرگ مانند سکانس‌دهی کل ژنوم، مطالعات متاژنومیک، ترانسکریپتومیکس و اپی‌ژنتیک.

***برای مطالعه بیشتر کلیک کنید***

تکنولوژی‌های مختلف سکانس‌ نسل بعدی (NGS)

Illumina (Sequencing by Synthesis – SBS)

از فلوروفورها برای تشخیص اضافه شدن هر نوکلئوتید استفاده می‌کند. نوکلئوتیدها به صورت فلوروسنتی نشاندار شده و هنگام اضافه شدن به زنجیره DNA، سیگنال‌های نوری تولید می‌کنند. ویژگی‌ها: دقت بالا، توانایی تولید حجم بالایی از داده‌ها. کاربردها: پروژه‌های بزرگ‌مقیاس، مانند سکانس‌دهی کل ژنوم و مطالعات پیچیده ژنتیکی.

Ion Torrent (Semiconductor Sequencing)

بر پایه تشخیص تغییرات pH ناشی از آزادسازی پروتون‌ها هنگام اتصال نوکلئوتیدها به زنجیره DNA کار می‌کند. ویژگی‌ها: سرعت بالا، هزینه کمتر، عدم نیاز به مواد فلوروسنت. کاربردها: تشخیص بالینی سریع، پروژه‌های کوچک‌مقیاس و کاربردهایی که نیاز به پاسخ سریع دارند.

Pacific Biosciences (PacBio) – Single Molecule Real-Time (SMRT) Sequencing

 از روش مشاهده مستقیم تک مولکول‌های DNA هنگام پلیمریزاسیون استفاده می‌کند. ویژگی‌ها: قابلیت تولید خوانش‌های طولانی، مناسب برای مطالعات پیچیده ساختار ژنوم. کاربردها: مطالعات ساختار ژنوم، توالی‌یابی ژنوم‌های بزرگ و پیچیده.

Oxford Nanopore Technologies

 از نانوپورها برای تشخیص نوکلئوتیدهای DNA هنگام عبور از طریق یک منفذ پروتئینی استفاده می‌کند. ویژگی‌ها: توانایی تولید خوانش‌های بسیار طولانی، دستگاه‌های قابل حمل. کاربردها: مطالعات ژنومیک در محیط‌های غیر آزمایشگاهی، پروژه‌های بزرگ‌مقیاس و تحلیل ساختار ژنوم.

کاربردها و اهمیت دستگاه‌های سکانس‌

تحقیقات پزشکی و درمانی: شناسایی جهش‌های ژنتیکی، تشخیص بیماری‌ها، توسعه درمان‌های شخصی‌سازی‌شده. کشاورزی: بهبود گیاهان و حیوانات از طریق مطالعات ژنتیکی. میکروبیولوژی: شناسایی و بررسی میکروارگانیسم‌ها در محیط‌های مختلف. مطالعات محیطی: بررسی تنوع زیستی و تغییرات اکوسیستم‌ها. این دستگاه‌ها و تکنولوژی‌ها به سرعت در حال توسعه و بهبود هستند و به دانشمندان امکان می‌دهند که به روش‌های نوآورانه‌تری به مطالعه و درک ژنوم‌ها بپردازند. دستگاه‌های سکانس‌ Ion Torrent از شرکت Thermo Fisher Scientific از تکنولوژی خاصی به نام سکانس‌ با استفاده از تراشه‌های نیمه‌رسانا استفاده می‌کنند. این تکنولوژی متفاوت از روش‌های مبتنی بر فلورسانس است که در سایر دستگاه‌های سکانس مانند Illumina به کار رفته است. در اینجا مراحل اصلی و ویژگی‌های کلیدی تکنولوژی Ion Torrent را شرح می‌دهیم:

مراحل کلیدی سکانس‌ با Ion Torrent:

آماده‌سازی نمونه: DNA هدف به قطعات کوچکتر تقسیم شده و به آداپتورها و بارکدها متصل می‌شود. این قطعات سپس به کره‌های میکروسکوپی متصل شده که هر کدام حاوی یک مولکول DNA منفرد هستند. تکثیر: کره‌ها به داخل یک قطره روغن منتقل شده و واکنش PCR در محیط امولسیون انجام می‌گیرد تا کپی‌های زیادی از هر قطعه DNA تولید شود. سکانس‌دهی: کره‌ها به داخل چاه‌های کوچک در تراشه نیمه‌رسانا قرار داده می‌شوند. در هر دوره، یک نوع نوکلئوتید به تراشه اضافه شده و در صورتی که نوکلئوتید به زنجیره DNA متصل شود، یک پروتون (H+) آزاد می‌شود. تشخیص سیگنال‌ها: آزادسازی پروتون‌ها باعث تغییر pH محیط می‌شود. تراشه‌های نیمه‌رسانا حساس به تغییرات pH هستند و این تغییرات را به سیگنال‌های الکترونیکی تبدیل می‌کنند که قابل ثبت و تجزیه و تحلیل هستند.

ویژگی‌های منحصر به فرد تکنولوژی Ion Torrent:

سرعت بالا: این روش به دلیل عدم نیاز به فرایندهای فلورسانس، به سرعت اطلاعات را پردازش می‌کند و نتایج را سریع‌تر از بسیاری دیگر از روش‌های سکانس‌دهی ارائه می‌دهد. هزینه کمتر: تولید و عملیات تراشه‌های نیمه‌رسانا معمولاً هزینه کمتری نسبت به تکنولوژی‌های فلورسانس دارد. سادگی تکنولوژی: نیاز به تجهیزات کمتر و فرآیند ساده‌تر، این روش را برای بسیاری از آزمایشگاه‌ها مناسب می‌سازد. با این حال، Ion Torrent ممکن است در مقایسه با سایر دستگاه‌ها مانند Illumina در دقت و قابلیت مدیریت خوانش‌های بسیار طولانی کمتر باشد، اما برای بسیاری از کاربردهای تحقیقاتی که نیاز به سرعت بالا و هزینه کمتر دارند، گزینه مناسبی است. دستگاه‌های سکانس‌دهی Ion Torrent که توسط شرکت Thermo Fisher Scientific تولید می‌شوند، از تکنولوژی مبتنی بر تراشه‌های نیمه‌رسانا استفاده می‌کنند تا توالی DNA را تعیین کنند. این فناوری بر پایه تشخیص تغییرات شیمیایی حاصل از فرآیند پلیمریزاسیون DNA است، بدون نیاز به استفاده از مواد فلورسنت یا نوری. در اینجا به صورت دقیق‌تر توضیح می‌دهم که این دستگاه چگونه کار می‌کند:

مراحل کاری دستگاه Ion Torrent:

آماده‌سازی لایبرری: DNA ابتدا به قطعات کوچکتر شکسته می‌شود و به هر قطعه آداپتورهای خاصی متصل می‌شوند که امکان اتصال به بیدهای میکروسکوپی را فراهم می‌کند. امولسیفیکیشن و PCR: قطعات DNA آماده شده به کره‌های میکروسکوپی بارگیری می‌شوند و درون قطرات روغن در یک واکنش PCR محلی تکثیر می‌یابند تا کپی‌های فراوان از هر قطعه DNA به دست آید. لودینگ تراشه: کره‌های حاوی DNA تکثیر شده به داخل چاه‌های کوچک روی یک تراشه نیمه‌رسانا منتقل می‌شوند. هر چاهک تنها یک کره را در خود جای می‌دهد. سکانس‌دهی: در هر دوره سکانس‌دهی، یک نوع نوکلئوتید به تمام چاه‌های تراشه اضافه می‌شود. اگر نوکلئوتید اضافه شده با قطعه DNA در چاهک مطابقت داشته باشد، به زنجیره DNA اضافه شده و یک مولکول H+ (پروتون) آزاد می‌کند. تشخیص سیگنال: آزادسازی پروتون‌ها منجر به تغییر جزئی در pH محیط درون چاهک می‌شود. این تغییر pH توسط حسگرهای نیمه‌رسانایی که در تراشه تعبیه شده‌اند تشخیص داده شده و به سیگنال‌های الکترونیکی تبدیل می‌شود. تجزیه و تحلیل داده‌ها: سیگنال‌های الکترونیکی جمع‌آوری شده از تراشه تجزیه و تحلیل می‌شوند تا توالی نهایی DNA به دست آید. این روش به خاطر سادگی و سرعت بالای آن محبوب است و برای کاربردهایی مانند توالی‌یابی میکروبیوم، تشخیص بالینی، و بررسی جهش‌های ژنتیکی که نیاز به پاسخ سریع دارند، ایده‌آل می‌باشد. دستگاه‌های سکانس‌دهی Ion Torrent از چندین قسمت اصلی تشکیل شده‌اند که هر کدام نقش مهمی در فرآیند سکانس‌دهی دارند. در زیر، اجزای کلیدی و کارکردهای آن‌ها را توضیح داده‌ام:

سیستم امولسیون PCR (Emulsion PCR System)

این سیستم برای انجام واکنش PCR به شکل امولسیون استفاده می‌شود. در این فرایند، قطعات DNA با آداپتورها به کره‌های میکروسکوپی مخصوص بارگیری شده و درون قطرات روغنی قرار می‌گیرند که محیط مناسبی برای تکثیر DNA فراهم می‌کنند. این کره‌ها سپس در تراشه سکانس‌دهی قرار می‌گیرند.

تراشه‌های نیمه‌رسانا (Semiconductor Chips)

تراشه‌ها قلب تکنولوژی Ion Torrent هستند. هر تراشه دارای هزاران چاهک میکروسکوپی است که هر چاه تنها یک کره را در خود جای می‌دهد. حسگرهای نیمه‌رسانایی در این تراشه‌ها وظیفه تشخیص تغییرات pH ناشی از آزادسازی پروتون‌ها را دارند که در نتیجه اتصال نوکلئوتیدها به زنجیره DNA رخ می‌دهد.

سیستم توزیع نوکلئوتید (Nucleotide Delivery System)

این سیستم مسئول توزیع نوکلئوتیدهای مورد نیاز برای فرایند سکانس‌دهی است. نوکلئوتیدها به ترتیب و به صورت دوره‌ای به تراشه اضافه می‌شوند، و هر نوع نوکلئوتید به طور جداگانه و در زمان مشخصی ارائه می‌شود.

دستگاه تصویربرداری و آنالیز داده‌ها (Imaging and Data Analysis System)

پس از آن که تغییرات pH در هر چاهک توسط حسگرهای نیمه‌رسانایی ثبت شد، داده‌های الکترونیکی به سیگنال‌های قابل تجزیه و تحلیل تبدیل می‌شوند. این سیستم داده‌ها را پردازش می‌کند و توالی نهایی DNA را تعیین می‌کند.

نرم‌افزار مدیریت داده‌ها (Data Management Software)

نرم‌افزار مدیریت داده‌ها برای تجزیه و تحلیل، ذخیره‌سازی و مدیریت داده‌های سکانس‌دهی طراحی شده است. این نرم‌افزار امکان مرور، تحلیل و مقایسه توالی‌ها را فراهم می‌کند و ابزارهایی برای تشخیص جهش‌ها، تغییرات ژنتیکی و سایر ویژگی‌های بیولوژیکی دارد. این اجزا در کنار هم کار می‌کنند تا یک سیستم سکانس‌دهی کارآمد و سریع را ارائه دهند که قادر است به سرعت و با دقت نسبتاً بالا توالی DNA را مشخص کند. Ion Torrent به خاطر سادگی و سرعت بالای خود در آزمایشگاه‌های تحقیقاتی و بالینی مورد استفاده قرار می‌گیرد. دستگاه‌های سکانس‌دهی DNA مانند Illumina و Ion Torrent دو تکنولوژی پیشرفته در زمینه ژنومیک هستند که با استفاده از روش‌ها و فناوری‌های مختلف، توالی DNA را تعیین می‌کنند. در ادامه، به توضیح مختصری در مورد هر دو دستگاه می‌پردازیم:

دستگاه سکانس Illumina

دستگاه‌های سکانس‌دهی Illumina از روشی به نام “سکانس‌دهی توسط سنتز” (Sequencing by Synthesis – SBS) استفاده می‌کنند. در این روش، کوتاه‌کننده‌های DNA به طور موقتی به دی‌ان‌ای که مورد مطالعه قرار می‌گیرد افزوده شده و هر بار که یک نوکلئوتید به زنجیره افزوده می‌شود، یک سیگنال نوری تولید می‌شود که توسط دستگاه ثبت می‌گردد. این روش امکان تولید میلیون‌ها خوانش موازی را فراهم می‌آورد و بسیار دقیق و حساس است.

دستگاه سکانس Ion Torrent

دستگاه‌های سکانس‌دهی Ion Torrent از روشی به نام “سکانس‌دهی توسط تراشه‌های نیمه‌رسانا” (Semiconductor sequencing) استفاده می‌کنند. در این روش، DNA بر روی یک تراشه نیمه‌رسانا قرار می‌گیرد و هر بار که یک نوکلئوتید به زنجیره DNA اضافه می‌شود، یک تغییر جزئی در pH رخ می‌دهد که توسط تراشه ثبت می‌شود. این فرآیند بدون نیاز به مواد نوری یا فلورسنت انجام می‌شود و می‌تواند بسیار سریع باشد، اما ممکن است کمی کمتر دقیق از روش Illumina باشد.

هر دو تکنولوژی نقاط قوت و ضعف خود را دارند و انتخاب بین آن‌ها بسته به نیازهای خاص پروژه ژنومیک و بودجه موجود است.

شرکت ایلومینا یکی از پیشروان در زمینه تکنولوژی سکانس‌دهی DNA است و از تکنولوژی خاصی به نام سکانس‌دهی توسط سنتز (Sequencing by Synthesis – SBS) استفاده می‌کند. این روش به شرح زیر عمل می‌کند:

مراحل کلی سکانس‌دهی توسط سنتز (SBS)

آماده‌سازی نمونه: ابتدا DNA هدف شکسته شده و به قطعات کوچک‌تر تقسیم می‌شود. این قطعات سپس با استفاده از آداپتورها با دی‌ان‌ای برچسب‌دار مرتبط می‌شوند. تکثیر قطعات DNA: قطعات DNA بر روی یک سطح جامد و پوشیده از اولیگونوکلئوتیدهای متصل به سطح پلیمریزه می‌شوند. این فرایند تکثیر از طریق PCR در جای خود (in-situ PCR) انجام می‌شود و کلاسترهایی از کپی‌های DNA تولید می‌کند. سکانس‌دهی: در مرحله سکانس‌دهی، نوکلئوتیدهای مختلف به نمونه‌های DNA اضافه می‌شوند. هر نوکلئوتید دارای یک مارکر فلورسنت است و زمانی که به زنجیره DNA اضافه می‌شود، یک سیگنال فلورسنت تولید می‌کند که توسط دستگاه ثبت می‌شود. تصویربرداری و تجزیه و تحلیل داده‌ها: پس از هر دوره اضافه کردن نوکلئوتید، دستگاه تصویربرداری انجام داده و سیگنال‌های فلورسنت را ثبت می‌کند. این سیگنال‌ها تجزیه و تحلیل می‌شوند تا توالی نهایی DNA تعیین شود.

ویژگی‌های منحصر به فرد تکنولوژی Illumina

دقت بالا: تکنولوژی Illumina به خاطر دقت بسیار بالای خود شناخته شده است، که این امر آن را برای تحقیقات دقیق ژنتیکی و پزشکی دقیق مناسب می‌سازد. توانایی خواندن طولانی: با پیشرفت‌های اخیر، دستگاه‌های Illumina می‌توانند خوانش‌های طولانی‌تری تولید کنند، که به مطالعه مناطق پیچیده ژنوم کمک می‌کند. کارایی بالا: این دستگاه‌ها قادر به تولید مقادیر زیادی داده در یک دوره کوتاه هستند، که برای پروژه‌های بزرگ مانند سکانس‌دهی ژنوم انسان بسیار مفید است. این تکنولوژی به پیشرفت‌های بزرگی در تحقیقات بیومدیکال و درک ما از بیولوژی پایه منجر شده است و ادامه دارد در حال توسعه و بهبود است تا دقت و کارایی بیشتری را ارائه دهد.

دستگاه‌های سکانس‌دهی شرکت ایلومینا از روش سکانس‌دهی توسط سنتز (Sequencing by Synthesis – SBS) استفاده می‌کنند که یکی از پیشرفته‌ترین و دقیق‌ترین روش‌ها در زمینه سکانس‌دهی DNA است. در اینجا به طور خلاصه و دقیق روند کار این روش را شرح می‌دهم:

بیشتر بخوانید:مقایسه DS-11 FX و NanoDrop OneC

آماده‌سازی نمونه: DNA مورد نظر برای سکانس‌دهی ابتدا به قطعات کوچک تقسیم شده و به آداپتورهایی متصل می‌شود که امکان متصل شدن به سطح فلوسل را فراهم می‌کنند. کلاستر گیری: قطعات DNA بر روی سطح ویژه‌ای به نام فلوسل قرار گرفته و در آنجا از طریق واکنش PCR محلی تکثیر می‌یابند تا کلاسترهای متراکمی از DNA مشابه ایجاد شوند. سکانس‌دهی: در مرحله سکانس‌دهی، نوکلئوتیدهای مخصوص که به فلوروفورها متصل هستند به ترتیب به قطعات DNA اضافه می‌شوند. هر نوکلئوتید به یک فلوروفور خاص متصل است که رنگ متفاوتی دارد. تصویربرداری: پس از افزودن هر نوکلئوتید، دستگاه تصویربرداری فلورسنسی انجام می‌دهد و رنگ‌های تولید شده توسط فلوروفورها را ثبت می‌کند. این رنگ‌ها نشان‌دهنده نوع نوکلئوتید افزوده شده به زنجیره DNA هستند. تجزیه و تحلیل داده‌ها: داده‌های تصویربرداری شده تجزیه و تحلیل می‌شوند تا توالی نهایی DNA به دست آید. این روش به واسطه دقت بالا و توانایی تولید حجم زیادی از داده‌ها به سرعت بسیار محبوب شده است و در بسیاری از زمینه‌های پژوهشی و کلینیکی مورد استفاده قرار می‌گیرد.

شرکت ایلومینا مجموعه‌ای از دستگاه‌های سکانس‌دهی را با استفاده از تکنولوژی سکانس‌دهی توسط سنتز (SBS) تولید کرده است. هر کدام از این دستگاه‌ها برای کاربردهای مختلفی طراحی شده‌اند و در زیر به توضیح مختصری در مورد برخی از محصولات اصلی ایلومینا می‌پردازیم:

1. HiSeq Series

HiSeq 2500/2000: این دستگاه‌ها قادر به انجام سکانس‌دهی با خروجی بسیار بالا هستند و برای مطالعات گسترده ژنومیک و ترانسکریپتومیک مناسب‌اند.

HiSeq X Ten: این سیستم به خصوص برای سکانس‌دهی کامل ژنوم طراحی شده و قابلیت انجام سکانس ژنوم‌های انسانی با هزینه پایین را دارد.

2. MiSeq

MiSeq: این دستگاه برای کاربردهایی با نیاز به خوانش‌های طولانی‌تر و دقت بالا، مانند توالی‌یابی متغیرهای ژنتیکی و مطالعات میکروبیوم، مناسب است. MiSeq برای آزمایشگاه‌های کوچکتر یا مطالعات با حجم نمونه کمتر ایده‌آل است.

3. NextSeq Series

NextSeq 500/550: این دستگاه‌ها ترکیبی از قابلیت‌های HiSeq و MiSeq را ارائه می‌دهند و برای مطالعات با مقیاس متوسط مناسب هستند. این سیستم‌ها قابلیت تنظیم برای خروجی‌های مختلف را دارند.

4. NovaSeq Series

NovaSeq 6000: این دستگاه جدیدترین و پیشرفته‌ترین سیستم سکانس‌دهی ایلومینا است که برای تولید داده‌های بسیار زیاد با هزینه کمتر طراحی شده است. NovaSeq برای پروژه‌های بسیار بزرگ مانند سکانس‌دهی کامل ژنوم و مطالعات اپی‌ژنتیک مناسب است. هر یک از این دستگاه‌ها با توجه به نیازهای خاص پژوهشی طراحی شده‌اند و انتخاب دستگاه مناسب بستگی به حجم داده مورد نظر، بودجه پروژه و جزئیات تکنیکی مورد نیاز دارد.

مقایسه تکنولوژی‌های سکانس‌دهی Illumina و Ion Torrent دو روش محبوب و کارآمد در سکانس‌دهی نسل بعدی (NGS) هستند، اما از نظر فناوری و کاربردها تفاوت‌های قابل توجهی دارند. در اینجا به مقایسه‌ی این دو تکنولوژی پرداخته‌ام:

1. روش‌ سکانس‌دهی

Illumina (Sequencing by Synthesis): از فلوروفورها برای تشخیص اضافه شدن هر نوکلئوتید استفاده می‌کند. در این روش، هر نوکلئوتید به یک مارکر فلورسنت متصل است و هنگامی که به زنجیره DNA اضافه می‌شود، سیگنالی نوری تولید می‌کند.

Ion Torrent (Semiconductor Sequencing): بر پایه آزادسازی پروتون‌ها هنگام اتصال نوکلئوتیدها به زنجیره DNA کار می‌کند. تغییرات pH ناشی از آزادسازی پروتون‌ها توسط تراشه‌های نیمه‌رسانا تشخیص داده شده و به سیگنال‌های الکترونیکی تبدیل می‌شود.

2. دقت و خطا

  Illumina: بسیار دقیق است و نرخ خطای پایینی دارد، به ویژه در خواندن‌های طولانی. این دقت بالا آن را برای تحقیقات پزشکی و برنامه‌های کلینیکی ایده‌آل می‌سازد.

 Ion Torrent: در حالی که سرعت بالایی دارد، ممکن است نرخ خطا به ویژه در خواندن‌های طولانی‌تر بالاتر باشد. این خطاها معمولاً ناشی از تجمع پروتون‌ها در تراشه‌های نیمه‌رسانا است.

3. سرعت

 Illumina:فرآیندهای خود می‌توانند زمان‌بر باشند، اما قادر به تولید حجم بالایی از داده‌ها در یک دوره زمانی مشخص هستند.

 Ion Torrent:به خاطر عدم نیاز به فلورسانس و سیستم تصویربرداری، دوره‌های سکانس‌دهی می‌توانند سریع‌تر باشند، که این سیستم را برای کاربردهای نیازمند به پاسخ سریع مناسب می‌سازد.

4. هزینه

Illumina: هزینه‌های اولیه و جاری ممکن است بیشتر از Ion Torrent باشد، اما این بستگی به مقیاس و نوع پروژه دارد.

Ion Torrent: معمولاً هزینه‌های کمتری دارد، به ویژه در پروژه‌های با حجم نمونه کوچک‌تر و محدود.

5. کاربردها

Illumina: مناسب برای مطالعات بزرگ مقیاس مانند سکانس‌دهی کامل ژنوم، مطالعات متاژنومیکس و اپی‌ژنتیک.

Ion Torrent: عالی برای پروژه‌های سریع و کاربردهایی مانند تشخیص بالینی، مطالعات محدود DNA و پروژه‌هایی با بودجه محدود. هر دو سیستم نقاط قوت و ضعف خاص خود را دارند و انتخاب بین آن‌ها بستگی به نیازهای خاص تحقیقاتی، بودجه موجود، و اولویت‌های پروژه دارد.

برای مطالعه بیشتر به مقله ذیل مراجعه فرمایید

این مقاله به بررسی مقایسه‌ای بین دو پلتفرم توالی‌یابی نسل جدید Illumina و Ion Torrent در زمینه تحلیل بیان دیفرانسیل ژن‌ها پرداخته است. برای این منظور، پاسخ التهابی کبد موش‌ها به درمان IL-1β مورد ارزیابی قرار گرفت. RNA استخراج شده از کبد موش‌ها با استفاده از هر دو پلتفرم Illumina HiSeq و Ion Torrent Proton توالی‌یابی شد.

این مقاله به بررسی مقایسه‌ای بین دو پلتفرم توالی‌یابی نسل جدید Illumina و Ion Torrent در زمینه تحلیل بیان دیفرانسیل ژن‌ها پرداخته است. برای این منظور، پاسخ التهابی کبد موش‌ها به درمان IL-1β مورد ارزیابی قرار گرفت. RNA استخراج شده از کبد موش‌ها با استفاده از هر دو پلتفرم Illumina HiSeq و Ion Torrent Proton توالی‌یابی شد.

لینک دانلود مقاله

کلام آخر

تکنولوژی‌های سکانس‌ Illumina و Ion Torrent دو روش محبوب و کارآمد در سکانس‌ نسل بعدی (NGS) هستند، اما از نظر فناوری و کاربردها تفاوت‌های قابل توجهی دارند. جهت دریافت مشاوره و خرید انواع دستگاه های سکانس با کارشناسان ما در ماناتک تماس حاصل فرمایید.