سیستم توالی یابی PacBio Sequel IIe یک فناوری توالی یابی نسل بعدی (NGS) است که می تواند خوانش های طولانی و دقیق DNA را ایجاد کند. از فناوری توالی یابی SMRT استفاده می کند که از توالی یابی تک مولکولی و ریل تایم (SMRT) برای ایجاد خواندن طولانی با دقت و وضوح بالا استفاده می کند. ویژگی های کلیدی: خوانش طولانی: این دستگاه می‌تواند خوانش‌هایی با طول 20 کیلوبایت ایجاد کند، که به طور قابل‌توجهی طولانی‌تر از فناوری‌های سنتی NGS است که خوانش در صدها پایه ایجاد می‌کند. این اجازه می دهد تا نقشه برداری با وضوح بالا و تشخیص ویژگی های پیچیده ژنومی، مانند انواع ساختاری و ترکیب کروماتین صورت پذیرد. دقت بالا: Sequel IIe به میانگین دقت پایه 99.9% دست می یابد که به طور قابل توجهی بالاتر از سایر فناوری های NGS است. این دقت بالا برای اسمبلی دقیق ژنوم ضروری است. توالی یابی در زمان واقعی:می تواند در زمان واقعی خوانش ایجاد کند و بازخورد فوری را در مورد پیشرفت آزمایشات به محققان ارائه دهد. این داده های ریل تایم را می توان برای عیب یابی مشکلات و انجام تنظیمات در صورت نیاز استفاده کرد.
آماده‌سازی خودکار نمونه: Sequel IIe کیت‌های آماده‌سازی نمونه به صورت خودکار را ارائه می‌دهد که فرآیند آماده‌سازی نمونه‌های DNA برای توالی‌یابی را ساده می‌کند. این اتوماسیون می تواند در وقت محققان صرفه جویی کند و خطر خطای انسانی را کاهش دهد. توالی یابی با توان بالا: می تواند تا 8 سلول SMRT را به طور همزمان توالی یابی کند و محققان را قادر می سازد تا حجم زیادی از داده ها را در مدت زمان کوتاهی تولید کنند. این قابلیت بازده بالا برای مطالعات ژنومی در مقیاس بزرگ ایده آل است.
مشخصات فنی
طول خواندن: حداکثر 20 کیلوبایت
میانگین دقت پایه: 99.9%
توان خواندن: تا 8 میلیون مطالعه در ساعت
آماده سازی نمونه: کیت های آماده سازی نمونه خودکار
نرم افزار تجزیه و تحلیل داده ها: نرم افزار تجزیه و تحلیل داده یکپارچه برای کنترل کیفیت و فراخوانش متفاوت variant calling)
کاربردها
سیستم توالی یابی PacBio Sequel IIe برای طیف گسترده ای از کاربردها مناسب است، از جمله: assembly ژنومی: assembly De novo ژنوم های باکتریایی، ویروسی و یوکاریوتی. تشخیص انواع ساختاری: شناسایی انواع ساختار، مانند درج، حذف، و وارونگی. تجزیه و تحلیل ترکیب کروماتین: نقشه برداری از ترکیب کروماتین و شناسایی عناصر تنظیمی. تشخیص جهش: تشخیص جهش های سوماتیک در ژنوم سرطان
Epigenomics : پروفایل متیلاسیون DNA و تغییرات هیستون: سیستم توالی یابی PacBio Sequel IIe یک ابزار قدرتمند برای محققانی است که طیف وسیعی از سوالات ژنومی را مطالعه می کنند. توانایی آن در ایجاد خواندن طولانی و دقیق، آن را به یک انتخاب عالی برای مونتاژ ژنوم، تشخیص انواع ساختاری و تجزیه و تحلیل ترکیب کروماتین تبدیل می کند.
فناوری توالی یابی SMRT
PacBio Sequel IIe از فناوری توالی یابی SMRT استفاده می کند که مخفف توالی یابی تک مولکولی و بلادرنگ است. توالی یابی SMRT با فناوری های سنتی NGS متفاوت است زیرا سیگنال فلورسانس ساطع شده از هر مولکول DNA را هنگام تعیین توالی دریافت می کند. این امکان تولید قرائت های طولانی و دقیق را فراهم می کند که با طول قطعه DNA در حال تعیین توالی محدود نمی شود.
خواندن طولانی برای نقشه برداری با وضوح بالا: توانایی Sequel IIe برای ایجاد خواندن طولانی یک مزیت قابل توجه برای انواع کاربردهای ژنومی است. خواندن طولانی نقشه برداری با وضوح بالا ارائه می دهد، به این معنی که آنها می توانند با دقت بیشتری به ژنوم مرجع نقشه برداری کنند. این برای مونتاژ دقیق ژنوم، تشخیص انواع ساختاری، و تجزیه و تحلیل ترکیب کروماتین مهم است. دقت بالا برای مونتاژ دقیق ژنوم: دقت بالای Sequel IIe یکی دیگر از ویژگی های کلیدی است که آن را به ابزاری ارزشمند برای تحقیقات ژنوم تبدیل می کند. میانگین دقت پایه آن 99.9 درصد به طور قابل توجهی بالاتر از سایر فناوری های NGS است که معمولاً دقتی در حدود 99 درصد دارند. این دقت بالا برای مونتاژ دقیق ژنوم ضروری است، زیرا تضمین می کند که ژنوم مونتاژ شده یک نمایش واقعی از توالی DNA اصلی است. توالی زمان واقعی برای گردش کار کارآمد: توانایی Sequel IIe برای تولید خواندن در زمان واقعی یکی دیگر از ویژگی های ارزشمندی است که می تواند گردش کار تحقیقاتی را بهبود بخشد. داده های بلادرنگ به محققان اجازه می دهد تا مشکلات را عیب یابی کنند و در صورت نیاز تنظیمات را انجام دهند، که می تواند باعث صرفه جویی در زمان و کاهش خطر خطا شود.
آماده سازی خودکار نمونه برای گردش کار ساده شده
Sequel IIe کیت های آماده سازی نمونه خودکار را ارائه می دهد که فرآیند آماده سازی نمونه های DNA را برای توالی یابی ساده می کند. این اتوماسیون می تواند در زمان و تلاش محققان صرفه جویی کند و همچنین می تواند به کاهش خطر خطای انسانی کمک کند. توالی با توان بالا برای مطالعات در مقیاس بزرگ: توانایی Sequel IIe برای تعیین توالی 8 سلول SMRT به طور همزمان، آن را به ابزاری قدرتمند برای مطالعات ژنومی در مقیاس بزرگ تبدیل می کند. این قابلیت بازده بالا به محققان اجازه می دهد تا حجم زیادی از داده ها را به سرعت و کارآمد تولید کنند.
کاربرد در زمینه های مختلف
تطبیق پذیری سیستم توالی یابی PacBio Sequel IIe به آن اجازه می دهد تا در کاربردهای مختلف از جمله: مجموعه ژنوم De novo: Sequel IIe می تواند برای جمع آوری ژنوم باکتری ها، ویروس ها و یوکاریوت ها از ابتدا استفاده شود. این یک ابزار ارزشمند برای مطالعه تنوع ژنتیکی موجودات است. تشخیص نوع ساختاری: این دستگاه را می توان برای شناسایی انواع ساختاری، مانند درج، حذف، و وارونگی در ژنوم موجودات استفاده کرد. این اطلاعات برای درک اساس ژنتیکی بیماری ها و برای توسعه درمان های جدید مهم است. تجزیه و تحلیل ترکیب کروماتین: این دستگاه را می توان برای ترسیم ساختار سه بعدی کروماتین، که سازمان پیچیده DNA و پروتئین ها در هسته یک سلول است، استفاده کرد. این اطلاعات برای درک چگونگی تنظیم ژن ها و عملکرد سلول ها مهم است.
تشخیص جهش: می‌تواند برای تشخیص جهش‌های جسمانی استفاده شود، جهش‌هایی که پس از تولد در سلول‌های یک ارگانیسم رخ می‌دهند. جهش های سوماتیک با سرطان و سایر بیماری ها مرتبط هستند. اپی ژنومیک: این دستگاه را می توان برای پروفایل متیلاسیون DNA و تغییرات هیستون، که اصلاحات شیمیایی است که می تواند بیان ژن را تنظیم کند، استفاده کرد. اپی ژنومیکس یک زمینه تحقیقاتی به سرعت در حال رشد است که بینش جدیدی در مورد علل بیماری ها ارائه می دهد.
نگاه کلی
سیستم توالی یابی PacBio Sequel IIe یک ابزار قدرتمند است که می تواند برای مطالعه طیف گسترده ای از سوالات بیولوژیکی مورد استفاده قرار گیرد. توانایی آن در ایجاد خواندن طولانی و دقیق، آن را به انتخابی ایده آل برای مونتاژ ژنوم، تشخیص انواع ساختاری و تجزیه و تحلیل ترکیب کروماتین تبدیل می کند. Sequel IIe هم برای کاربردهای تحقیقاتی و هم برای کاربردهای بالینی مناسب است و مطمئناً نقش مهمی در پیشرفت تحقیقات ژنومی در سال‌های آینده خواهد داشت. جهت دریافت مشاوره تخصصی و خرید انواع دستگاه های مولکولی با کارشناسان ما در ماناتک تماس حاصل فرمایید.
نقد و بررسی‌ها
هنوز بررسی‌ای ثبت نشده است.