دوره آموزش شبیه سازی Molecular Docking

معرفی دوره

شبیه‌سازی داکینگ مولکولی (Molecular Docking) یکی از ارکان کلیدی و تحول‌آفرین در حوزه بیوانفورماتیک و طراحی داروی محاسباتی است که به پژوهشگران اجازه می‌دهد پیش از انجام آزمایش‌های پرهزینه آزمایشگاهی، نحوه اتصال و برهم‌کنش یک لیگاند (دارو) را با گیرنده پروتئینی هدف با دقت بالایی پیش‌بینی کنند. این فناوری با کاهش چشمگیر زمان و هزینه‌های اکتشاف دارو، مسیر ورود ترکیبات جدید به عرصه درمان را هموارتر از همیشه کرده است.

در این دوره جامع، شما گام‌به‌گام از مفاهیم تئوری تا تسلط بر تکنیک‌های عملی شبیه‌سازی داکینگ مولکولی را فرا خواهید گرفت. این دوره با هدف آموزش کاربردی طراحی شده و در جلسات ابتدایی، شما را با ماهیت داکینگ در اکتشاف دارو و نحوه کار با پایگاه داده‌های معتبر مانند PDB آشنا می‌کند. در ادامه، مراحل دقیق و استاندارد آماده‌سازی پروتئین و لیگاند، و همچنین روش‌های شناسایی سایت‌های فعال (Active Site) را می‌آموزید.

بخش عملی این دوره به کار با دو ابزار قدرتمند دنیای بیوانفورماتیک یعنی AutoDock 4 و AutoDock Vina اختصاص دارد تا بتوانید شبیه‌سازی‌های خود را با دقت بالا اجرا کنید. در بخش پایانی، تمرکز اصلی بر تحلیل حرفه‌ای نتایج است؛ از مشاهده و تفسیر برهم‌کنش‌ها تا درک عمیق مفهوم «انرژی پیوند» (Binding Energy). همچنین برای تکمیل مهارت‌های شما، تکنیک‌های داکینگ با چندین لیگاند (Virtual Screening) را نیز بررسی می‌کنیم تا بتوانید پروژه‌های تحقیقاتی خود را با اعتمادبه‌نفس کامل و با استانداردهای علمی روز دنیا پیش ببرید.

مدرس دوره: احسان کرامتی – دکترای تخصصی ژنتیک

آکادمی بیولوژی کرامتی

جلسه 1: مقدمه

جلسه 2: آشنایی با پایگاه داده PDB

جلسه 3: آماده سازی پروتئین

جلسه 4: آماده سازی لیگاند

جلسه 5: شناسایی اکتیو سایت

جلسه 6: شبیه سازی داکینگ مولکولی با Autodock 4

جلسه 7: مشاهده نتایج

جلسه 8: شبیه سازی داکینگ مولکولی با Autodock Vina

جلسه 9: تفسیر نتایج

جلسه 10: تفسیر نتایج داکینگ با چند لیگاند

جلسات

دانلود فایل دوره