دوره آموزش آنالیز شبکه های زیستی

معرفی دوره

در دنیای مدرن بیولوژی، دیگر مطالعه‌ی تک‌بعدی ژن‌ها و پروتئین‌ها برای درک پیچیدگی‌های حیات کافی نیست و اینجاست که بیولوژی سامانه‌ای (Systems Biology) به عنوان یک رویکرد کل‌نگر وارد میدان می‌شود. آنالیز شبکه‌های زیستی ابزاری قدرتمند است که به ما اجازه می‌دهد تعاملات میان اجزای سلولی را در قالب گراف‌های پیچیده مدل‌سازی کنیم. در این شبکه‌ها، مفاهیمی همچون سنترالیتی (Centrality) یا شاخص‌های مرکزیت به ما کمک می‌کنند تا نفوذ و اهمیت هر گره را بسنجیم و گره‌های حیاتی موسوم به هاب‌جین‌ها (Hub Genes) را شناسایی کنیم؛ ژن‌هایی که به دلیل تعداد بالای اتصالات، نقش فرماندهی را در مسیرهای بیولوژیک ایفا می‌کنند و اغلب بهترین اهداف درمانی برای بیماری‌های سخت‌درمان به شمار می‌روند.

دوره حاضر با نگاهی جامع به این حوزه، در چهار گام اصلی تدوین شده است تا شما را از مفاهیم تئوریک به توانایی اجرای پروژه‌های عملی برساند. ما در جلسه اول به بررسی مقدمات و مفاهیم اولیه می‌پردازیم تا ذهنیت درستی از ساختار شبکه‌ها پیدا کنید. سپس در جلسه دوم، وارد دنیای برنامه‌نویسی می‌شویم و یاد می‌گیریم که چگونه با استفاده از زبان R، برهمکنش‌های اختصاصی خود را از دل دیتاست‌های خام استخراج کنیم. در جلسه سوم، روی منابع عظیم داده تمرکز کرده و روش‌های دانلود و کار با دیتاست‌های معتبر برهمکنش‌ها نظیر STRING و TarBase را بررسی می‌کنیم. در نهایت و در جلسه چهارم، تمامی این مهارت‌ها را در قالب یک پروژه عملی آنالیز شبکه به کار می‌بندیم تا شما آماده‌ی انجام پژوهش‌های مستقل در سطح استانداردهای جهانی شوید.

مدرس دوره: احسان کرامتی – دکترای تخصصی ژنتیک

آکادمی بیولوژی کرامتی

جلسات

جلسه 1: مقدمه و مفاهیم اولیه

جلسه 2: جستجوی برهمکنش ها در دیتاست

جلسه 3: دانلود دیتاست های برهمکنش ها

جلسه 4: معرفی یک پروژه آنالیز شبکه

دانلود فایل دوره

این دوره فایلی ندارد