دوره آموزش متا آنالیز داده های بیان ژن

معرفی دوره

این دوره در قالب سه جلسه آموزشی طراحی شده تا نحوه انجام متاآنالیز روی داده‌های بیان ژن را به‌صورت کاربردی و گام‌به‌گام آموزش دهد. در جلسه اول، پس از ارائه مقدمه‌ای بر مفهوم و کاربرد متاآنالیز در تحلیل داده‌های بیان ژن، به معرفی روش‌های رایج پرداخته می‌شود. در همین جلسه، روش اول که مبتنی بر آنالیز مجزای هر GSE و سپس یافتن اشتراک ژن‌های حاصل از نتایج هر GSE است، به‌صورت عملی پیاده‌سازی می‌شود؛ روشی که برای شناسایی ژن‌های کلیدی مشترک بین مطالعات مستقل کاربرد دارد.

در جلسه دوم، وارد روش دوم و پیشرفته‌تر متاآنالیز می‌شویم که مبتنی بر ادغام مستقیم ماتریس‌های بیان ژن از پلتفورم‌های مختلف، از جمله داده‌های مایکرواری و RNA-seq، است. در این جلسه مراحل تمیزکاری ماتریس‌های داده، حفظ ژن‌های با سطح بیان پایین در هر ماتریس، یکسان‌سازی آیدی ژن‌ها بین ماتریس‌های مختلف، و در نهایت اشتراک‌گیری و ادغام نهایی ماتریس‌ها به‌طور کامل توضیح داده می‌شود. این روش به‌دلیل حفظ ساختار داده‌های خام و امکان انجام تحلیل‌های داون‌استریم دقیق‌تر (نظیر آنالیزهای شبکه‌ای، خوشه‌بندی و بیوانفورماتیک پیشرفته)، برای مقالاتی که تمرکز اصلی آن‌ها بر بیوانفورماتیک است، مناسب‌تر و رایج‌تر است.

جلسه سوم نیز به تکمیل و ادامه مباحث عملی جلسه دوم اختصاص دارد و شرکت‌کنندگان با تمرین بیشتر، مهارت لازم برای اجرای کامل فرآیند ادغام و متاآنالیز داده‌های بیان ژن را به‌دست می‌آورند.

مدرس دوره: احسان کرامتی – دکترای تخصصی ژنتیک

آکادمی بیولوژی کرامتی

جلسات

جلسه اول: مقدمه و روش اول

جلسه دوم: روش دوم

جلسه سوم: ادامه مباحث جلسه دوم

دانلود فایل دوره