دوره آموزش GWAS

معرفی دوره

در این دوره آموزشی GWAS (Genome‑Wide Association Study) تلاش شده مسیر یادگیری به‌صورت مرحله‌به‌مرحله و از مفاهیم پایه آغاز شود تا شرکت‌کنندگان بدون نیاز به پیش‌زمینه عمیق بتوانند به‌تدریج وارد مباحث تحلیلی شوند. ابتدا با مفاهیم بنیادین ژنتیک جمعیت، مارکرهای ژنتیکی و داده‌های SNP Array آشنا می‌شویم و درک می‌کنیم که مطالعات GWAS چگونه برای شناسایی ارتباط میان واریانت‌های ژنتیکی و صفات مورد استفاده قرار می‌گیرند. سپس نحوه جستجو و دریافت داده‌های واقعی ژنومی از پایگاه‌های داده عمومی مانند GEO (Gene Expression Omnibus) آموزش داده می‌شود تا شرکت‌کنندگان بتوانند داده‌های مناسب برای تحلیل را پیدا و دانلود کنند.

در ادامه، مراحل پیش‌پردازش (Preprocessing) و کنترل کیفیت (Quality Control) داده‌های ژنوتیپی به‌صورت عملی بررسی می‌شود؛ از جمله فیلتر کردن مارکرها و نمونه‌ها، بررسی فراوانی آلل‌ها، مدیریت داده‌های گمشده و آماده‌سازی داده‌ها برای تحلیل‌های آماری. پس از آماده‌سازی داده‌ها، وارد بخش اصلی تحلیل‌های GWAS می‌شویم و کار با نرم‌افزارهای پرکاربردی مانند PLINK و TASSEL را به‌صورت گام‌به‌گام یاد می‌گیریم. در این بخش شرکت‌کنندگان با اجرای تست‌های ارتباطی، تفسیر نتایج، و بررسی خروجی‌هایی مانند Manhattan plot و QQ plot آشنا خواهند شد.

هدف این دوره آن است که شرکت‌کنندگان بتوانند از مرحله یافتن داده‌های خام تا اجرای یک تحلیل کامل GWAS را به‌صورت عملی تجربه کنند و مهارت لازم برای انجام این نوع مطالعات در پروژه‌های پژوهشی خود را به دست آورند.

مدرس دوره: احسان کرامتی – دکترای تخصصی ژنتیک

آکادمی بیولوژی کرامتی

جلسات

جلسه 1: شرح کامل تکنیک GWAS

دانلود فایل دوره