دوره آموزش آنالیز داده های WGB-seq

معرفی دوره

این دوره یک مسیر عملی و مرحله‌به‌مرحله برای آشنایی و انجام آنالیز داده‌های Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) ارائه می‌کند. در ابتدای دوره، مفاهیم پایه، کاربردها و کلیات داده‌های بیسولفایت‌سکوئنسینگ معرفی می‌شود و سپس فرآیند کامل تحلیل داده‌ها از دریافت فایل‌های خام از پایگاه داده SRA آغاز می‌گردد. در ادامه، تبدیل داده‌ها به فرمت FASTQ با استفاده از SRA Toolkit، کنترل کیفیت خوانش‌ها با FastQC، تریم کردن داده‌ها با Trimmomatic، الاین کردن خوانش‌ها روی ژنوم رفرنس با BSBolt و انجام methylation calling آموزش داده می‌شود. در نهایت، شرکت‌کنندگان با تحلیل نواحی دارای متیلاسیون متفاوت و شناسایی DMRها با استفاده از پکیج DSS آشنا می‌شوند و یک پایپ‌لاین کاربردی برای تحلیل داده‌های WGBS را از داده خام تا تفسیر نتایج فرا می‌گیرند.

مدرس دوره: احسان کرامتی – دکترای تخصصی ژنتیک

آکادمی بیولوژی کرامتی

جلسات

جلسه 1: مقدمه و مبانی آنالیز داده‌های اپی‌ژنتیک (WGBS)

جلسه 2: پیش‌پردازش، الاینمنت و استخراج متیلاسیون (BSBolt)

جلسه 3: آنالیز آماری و شناسایی DMRها با پکیج DSS

دانلود فایل ها