کارگاه ژنومیکس تشخیصی مبتنی بر NGS در لیکوئید بایوپسی

معرفی کارگاه

این کارگاه در هفدهمین کنگره بین‌المللی و بیست‌وسومین کنگره کشوری ارتقاء کیفیت خدمات آزمایشگاهی تشخیص پزشکی ایران در مرکز همایش‌های برج میلاد برگزار شد.

در بخش نخست کارگاه، دکتر کرامتی به بررسی مفهوم بایوپسی، انواع آن و تفاوت‌های بایوپسی بافتی و مایع پرداختند. در ادامه، لیکوئید بایوپسی، مزایا و محدودیت‌های آن و کاربردهای مختلف این روش در غربالگری، تشخیص، پایش و ارزیابی بیماری‌ها مورد بررسی قرار گرفت. همچنین تاریخچه شکل‌گیری و توسعه لیکوئید بایوپسی و مسیر ورود آن از کاربردهای پژوهشی به حوزه بالین مرور شد.

در ادامه، آنالیت‌های مهم قابل بررسی در لیکوئید بایوپسی، از جمله ctDNA، cfDNA، cfRNA، اگزوزوم‌ها و سلول‌های توموری در گردش (CTC) معرفی شدند و درباره پلتفرم‌ها و پنل‌های مورد استفاده، استراتژی‌های تشخیصی و نحوه انتخاب رویکرد مناسب برای کاربردهای مختلف بالینی توضیح داده شد. بخش قابل‌توجهی از این قسمت نیز به کاربرد لیکوئید بایوپسی در غربالگری و تشخیص سرطان و سایر کاربردهای بالینی اختصاص داشت.

در بخش دوم کارگاه، دکتر شعله به جنبه‌های ژنومیکس و تحلیل داده‌های NGS پرداختند و مراحل پردازش و تحلیل داده‌های حاصل از توالی‌یابی نمونه‌های لیکوئید بایوپسی را بررسی کردند؛ از داده‌های خام توالی‌یابی تا تحلیل‌های ژنومی و شناسایی تغییرات مولکولی قابل استفاده در تفسیرهای تشخیصی.

به این ترتیب، کارگاه یک مسیر پیوسته را از مبانی بایوپسی و کاربردهای بالینی لیکوئید بایوپسی، تا استفاده از NGS و تحلیل داده‌های ژنومیکس دنبال می‌کند.

مدرسین کارگاه:

احسان کرامتی – دکترای تخصصی ژنتیک

محمد شعله – دکترای تخصصی باکتری شناسی پزشکی

آکادمی بیولوژی کرامتی

ویدیو کارگاه:

فایل ضبط شده از کارگاه

اسلایدهای کارگاه