مقایسه انواع استریپ ها
مقدمه
استریپ مخصوص ریل تایم پی سی آر یک نوع استریپ پلاستیکی است که برای قرار دادن نمونه های DNA یا RNA در دستگاه ریل تایم پی سی آر استفاده می شود. این استریپ ها دارای چندین حفره کوچک هستند که هر کدام می توانند حدود 0.2 میلی لیتر از نمونه را در خود جای دهند. این استریپ ها باید با درب های مناسب بسته شوند تا از تبخیر و آلودگی نمونه ها جلوگیری کنند.
در انجام روش Real time pcr با توجه به برند و مدل دستگاه باید از انواع خاصی از استریپ ها استفاده کرد، اگر چه با وجود اشتراکات زیاد بین انواع تیوپ ها تفاوت هایی جزئی نیز دیده می شود.
در حالی که در بسیاری از ترموسایکلرها، خوانش سیگنال از درب استریپ (cap) صورت می گیرد اما برخی دیگر از کناره های استریپ سیگنال را جذب می کنند.
-
نسبت سیگنال به نویز(S/N) در دستگاه هایی که از cap جذب سیگنال صورت می گیرد
- استریپ سفید(White) نسبت سیگنال به نویز بالا (بهترین انتخاب)
سازگار با اکثر ابزارهای Real time PCR، از جمله Exicycler™ 96 ،Light Cycler® 480 ،Light Cycler® 96
- استریپ نیمه شفاف (Frosted) نسبت سیگنال به نویز متوسط
- استریپ شفاف (Clear) نسبت سیگنال به نویز ضعیف
2. خوانش سیگنال از دیواره استریپ
در اینجا بهتر است از استریپ های شفاف با درب سفید استفاده شود چرا که جذب سیگنال را به بالاترین حد خود می رساند اما می شود از استریپ های کاملا شفاف و نیمه شفاف هم استفاده کرد.
- استریپ شفاف با درب سفید نسبت سیگنال به نویز بالا (بهترین انتخاب)
- استریپ شفاف نسبت سیگنال به نویز بالا
- استریپ نیمه شفاف نسبت سیگنال به نویز متوسط
- استریپ سفید نسبت سیگنال به نویز ضعیف
موضوع بعد که باید برای انتخاب درست نوع استریپ مدنظر داشته باشیم، نوع مستر میکس (داری ROX و بدون ROX) مصرفی است؛
| No ROX | ROX-dependent | |
| Bio-Rad
Roche Eppendorf |
ABI
Stratagene Biometra |
Machine Brands |
| No | Yes | Dose master mix including ROX |
| White>Frosted>Clear | White=Frosted=Clear | Ct value difference among White, Frosted, Clear tubes |
