معرفی
دستگاه با شعار خواندن توالی( HIFI ) بیشتر، نمونه های بیشتر، کشف بیشتر وارد بازار شد و نسل بعدی آن مدل PacBio RS II می باشد. این دستگاه نسل چهارم سیستم های سکانس شرکت می باشد.
طول قطعات مورد خوانش 15-18 کیلوباز با دقت 99.95% است، Revio از 4 سلول SMART با چگالی بالا پشتیبانی می کند. هر سلول SMRT حاوی 25 میلیون ZMW است و زمان اجرا از 30 به 24 ساعت کاهش یافته است. این افزایش قابل توجهی نسبت به Sequel IIe است که یک سلول SMRT را اجرا می کرد که تنها 8 میلیون ZMW را برای یک اجرای توالی 30 ساعته پشتیبانی می کرد. ارتقاء سلول های سیستم باعث افزایش 15 برابری نسبت به دستگاه های نسل قبلی خود شده است.
خروجی داده Revio تا 90 گیگ باز در هر سلول SMRT یا در مجموع 360 گیگ باز خواندن( HiFi ) در روز است. خوانش HiFi با فرمت BAM خروجی داده می‌شود.
Revio مجهز به پردازنده‌های گرافیکی NVIDIA برای قدرت محاسباتی 20 برابر بالاتر از ابزارهای قبلی خود است. علاوه بر این، گوگل با PacBio همکاری کرد تا Google Health DeepConsensus را تولید کند تا در این ابزار گنجانده شود. Google Health DeepConsensus از فناوری یادگیری عمیق برای تصحیح خطاها در طول توالی‌یابی استفاده می‌کند و منجر به افزایش بازده داده و دقت در خوانش می‌شود.
شرکت تولید کننده: pacbio
شرکت Pacific Biosciences (که به اختصار PacBio نیز خوانده می‌شود) یک شرکت فناوری زیستی آمریکایی است که در سال 2004 تأسیس شد. این شرکت به طور اختصاصی در زمینه پلیمراز زنجیره‌ای تک‌مولکولی (Single Molecule Real-Time Sequencing) فعالیت می‌کند. فناوری SMRT Sequencing، که توسط PacBio به بازار عرضه شده است، به دستگاه‌های DNA sequencing امکان می‌دهد تا با دقت و سرعت بالا، توالی DNA را بخوانند. در حال حاضر، شرکت PacBio سری دستگاه‌های Sequel و Sequel II را تولید می‌کند که به عنوان دستگاه‌های DNA تک‌مولکولی پیشرفته شناخته می‌شوند. این دستگاه‌ها می‌توانند توالی‌گیری DNA را با دقت بالا انجام دهند و در تحقیقات بیولوژیکی، ژنتیک، پزشکی و دیگر زمینه‌های مرتبط با DNA sequencing کاربرد دارند. شرکت PacBio با محصولات و فناوری‌های خود، در حال حاضر در بازار DNA sequencing جهانی شناخته شده است و مشتریان و همکاران زیادی در سراسر جهان دارد.
کشور: آمریکا
کارایی اصلی: خوانش توالی و سکانس
بهترین ویژگی دستگاه: انجام خوانش های طولانی و سریع
زمینه ی اصلی استفاده از: انجام خوانش های طولانی
برنامه های کاربردی:
- واریانت هایی مثل(SNVs, indels, SVs)
- توالی یابی کل ژنوم
- Single-cell transcriptomic
- پانل های ژنی بزرگ
- شناسایی 5mC در سایت های CpG
مشخصات توالی
مشخصات دستگاه
- مقایسه دو نسل در کنارهم
- میزان خوانش Revio، 15 برابر خوانش sequal II می باشد
نقد و بررسی‌ها
هنوز بررسی‌ای ثبت نشده است.