معرفی
دستگاه با شعار خواندن توالی( HIFI ) بیشتر، نمونه های بیشتر، کشف بیشتر وارد بازار شد و نسل بعدی آن مدل Pac Bio RS II می باشد. این دستگاه نسل چهارم سیستم های سکانس شرکت می باشد.
طول قطعات مورد خوانش 15-18 کیلو باز با دقت 99.95% است، Revio از 4 سلول SMART با چگالی بالا پشتیبانی می کند. هر سلول SMRT حاوی 25 میلیون ZMW است و زمان اجرا از 30 به 24 ساعت کاهش یافته است. این افزایش قابل توجهی نسبت به Sequel IIe است که یک سلول SMRT را اجرا می کرد که تنها 8 میلیون ZMW را برای یک اجرای توالی 30 ساعته پشتیبانی می کرد. ارتقاء سلول های سیستم باعث افزایش 15 برابری نسبت به دستگاه های نسل قبلی خود شده است.
خروجی داده Revio تا 90 گیگ باز در هر سلول SMRT یا در مجموع 360 گیگ باز خواندن( HiFi ) در روز است. خوانش HiFi با فرمت BAM خروجی داده می شود.
Revio مجهز به پردازنده های گرافیکی NVIDIA برای قدرت محاسباتی 20 برابر بالاتر از ابزارهای قبلی خود است. علاوه بر این، گوگل با Pac Bio همکاری کرد تا Google Health Deep Consensus را تولید کند تا در این ابزار گنجانده شود. Google Health Deep Consensus از فناوری یادگیری عمیق برای تصحیح خطاها در طول توالی یابی استفاده می کند و منجر به افزایش بازده داده و دقت در خوانش می شود.
شرکت تولید کننده: pac bio
شرکت Pacific Biosciences (که به اختصار Pac Bio نیز خوانده می شود) یک شرکت فناوری زیستی آمریکایی است که در سال 2004 تأسیس شد. این شرکت به طور اختصاصی در زمینه پلیمراز زنجیره ای تک مولکولی (Single Molecule Real-Time Sequencing) فعالیت می کند. فناوری SMRT Sequencing، که توسط Pac Bio به بازار عرضه شده است، به دستگاه های DNA sequencing امکان می دهد تا با دقت و سرعت بالا، توالی DNA را بخوانند. در حال حاضر، شرکت Pac Bio سری دستگاه های Sequel و Sequel II را تولید می کند که به عنوان دستگاه های DNA تک مولکولی پیشرفته شناخته می شوند. این دستگاه ها می توانند توالی گیری DNA را با دقت بالا انجام دهند و در تحقیقات بیولوژیکی، ژنتیک، پزشکی و دیگر زمینه های مرتبط با DNA sequencing کاربرد دارند. شرکت Pac Bio با محصولات و فناوری های خود، در حال حاضر در بازار DNA sequencing جهانی شناخته شده است و مشتریان و همکاران زیادی در سراسر جهان دارد.
کشور: آمریکا
کارایی اصلی: خوانش توالی و سکانس
بهترین ویژگی دستگاه: انجام خوانش های طولانی و سریع
زمینه ی اصلی استفاده از: انجام خوانش های طولانی
برنامه های کاربردی:
- واریانت هایی مثل(SNVs, indels, SVs)
- توالی یابی کل ژنوم
- Single-cell transcriptomic
- پانل های ژنی بزرگ
- شناسایی 5mC در سایت های CpG
مشخصات توالی
مشخصات دستگاه
- مقایسه دو نسل در کنار هم
- میزان خوانش Revio، 15 برابر خوانش sequal II می باشد
دیدگاهها
هیچ دیدگاهی برای این محصول نوشته نشده است.