شرکت ایلومینا یکی از پیشروان در تکنولوژی توالییابی DNA و RNA است و تاکنون چندین نسل دستگاههای توالییابی تولید کرده است. در اینجا به ترتیب از نسل آخر به اول به معرفی این دستگاهها میپردازم:
NovaSeq X Series
NovaSeq X و NovaSeq X Plus: این دستگاهها در سال 2022 معرفی شدند و توانایی توالییابی در مقیاس بسیار بالا با کاهش هزینهها و زمان عملیاتی را دارند. این سری میتواند تا 20,000 گیگابیس ویژه تولید کند و برای پروژههای بزرگ ژنومی مناسب است.
NovaSeq 6000 Series
معرفی شده در سال 2017، این دستگاه برای پروژههای با مقیاس بزرگ و کاربردهای متعدد از جمله توالییابی ژنوم کامل، اگزوم و ترانسکریپتوم به کار میرود. نوازسک 6000 قابلیتهای بالایی در تولید دادههای توالییابی با دقت بالا دارد.
HiSeq X Series
توسعه یافته برای توالییابی ژنوم کامل در مقیاس بزرگ، این سری میتواند هزینههای توالییابی ژنوم انسان را به زیر 1,000 دلار کاهش دهد. هایسک X برای مطالعات ژنومیک جمعیتی و پروژههای ژنومیک انسان مفید است.
HiSeq Series
این سری شامل چندین مدل مانند HiSeq 2000، HiSeq 2500، HiSeq 3000 و HiSeq 4000 است. هر کدام از این مدلها برای کاربردهای مختلف در تحقیقات بیولوژیک و پزشکی مناسب است و قابلیتهایی مانند قابلیت انعطافپذیری در تولید داده، دقت بالا و سرعت در توالییابی را دارا هستند.
MiSeq Series
مایسک برای توالییابی در مقیاس کوچکتر، مانند توالییابی میکروبیوم، تحقیقات ویروسی و کاربردهای دیاگنوستیکی طراحی شده است. این دستگاه میتواند توالییابی با دقت بالا را در یک دوره زمانی کوتاه انجام دهد.
NextSeq Series
نکست سک قابلیتهای مختلفی برای توالییابی در مقیاس متوسط ارائه میدهد و برای طیف گستردهای از کاربردهای تحقیقاتی مناسب است، از جمله توالییابی ترانسکریپتوم و توالییابی اگزوم. اینها نمونههایی از دستگاههای توالییابی ایلومینا هستند که نشان دهنده پیشرفتهای تکنولوژیک در این حوزه و تأثیر آنها بر پژوهشهای ژنتیکی و بیومدیکال است. اما برای کاملکردن بحث، میتوانیم به برخی دیگر از محصولات قدیمیتر و تخصصیتر نیز اشاره کنیم:
GAIIx (Genome Analyzer IIx):
این دستگاه که پیش از سری HiSeq عرضه شده بود، یکی از اولین دستگاههای توالییابی نسل جدید بود که توسط ایلومینا به بازار عرضه شد. GAIIx برای تحقیقات ژنتیکی که نیاز به توالییابی با دقت بالا دارند، استفاده میشد و قادر به انجام توالییابی تکرشتهای و دو رشتهای بود.
cBot:
بیشتر بخوانید:“آزمایش غیر تهاجمی دوران بارداری (NIPT): سفری انقلابی در آزمایشهای دوران بارداری”
cBot یک سیستم آمادهسازی نمونه اتوماتیک است که برای آمادهسازی نمونهها قبل از توالییابی در دستگاههای HiSeq و NextSeq استفاده میشود. این دستگاه نقش مهمی در افزایش کارایی و دقت آمادهسازی نمونهها دارد. این محصولات نشاندهنده تکامل تکنولوژی توالییابی در ایلومینا و نقش آنها در پیشبرد دانش ژنتیک و ژنومیکس است. برای دستگاههای توالییابی نسل جدید ایلومینا، مقایسه دو به دو را بر اساس مدلهایی که قبلاً ذکر شد انجام میدهیم تا بتوانیم تفاوتهای کلیدی بین هر جفت را مشخص کنیم:
1. NovaSeq X Series vs NovaSeq 6000 Series
ظرفیت توالییابی: NovaSeq X Series قادر است دادههای بیشتری در مقایسه با NovaSeq 6000 تولید کند، که این امر آن را برای پروژههای بزرگمقیاس ایدهآل میسازد. فناوری: NovaSeq X از فناوریهای جدیدتر و بهبود یافتهای برخوردار است که سرعت بالاتر و کارایی بهتری را در توالییابی ارائه میدهد. هزینه عملیاتی: به دلیل بهبودهای تکنولوژیک، NovaSeq X ممکن است در درازمدت هزینههای عملیاتی پایینتری نسبت به NovaSeq 6000 داشته باشد.
2. HiSeq X Series vs HiSeq Series
منظور طراحی: HiSeq X به خصوص برای توالییابی ژنوم انسان در مقیاس بسیار بزرگ طراحی شده بود، در حالی که HiSeq Series برای انواع متنوعتری از توالییابیها، از ترانسکریپتومها گرفته تا توالیهای کوچکتر، مناسب است. ظرفیت توالییابی: HiSeq X برای پردازش تعداد بسیار زیادی از نمونهها به طور همزمان طراحی شده است، در حالی که HiSeq انعطافپذیری بیشتری برای انجام دادن توالییابیهای با مقیاس متفاوت دارد.
MiSeq Series vs NextSeq Series3.
مقیاس کاربرد: MiSeq برای توالییابی با مقیاس کوچکتر و دقت بالا، مانند بررسیهای دیاگنوستیکی و تحقیقات میکروبیال مناسب است. NextSeq برای مقیاس متوسط و با قابلیت تنظیم بین تولید دادههای بالا و کم مناسب است. سرعت توالییابی: NextSeq عموماً سرعت بالاتری نسبت به MiSeq دارد و برای پروژههای نیازمند تحویل سریع دادهها ایدهآل است. قابلیتهای تکنولوژیکی: NextSeq از نظر فناوری پیشرفتهتر است و امکان پذیرش نمونههای بیشتری را فراهم میکند، در حالی که MiSeq برای دقت و تفصیل بیشتر در توالیهای کوتاه مطلوب است. این تفاوتها نشاندهنده تمرکز هر دستگاه بر کاربردهای خاص در زمینه توالییابی است و کمک میکند تا کاربران بتوانند دستگاه مناسب برای نیازهای خاص تحقیقاتی خود را انتخاب کنند.
نگاه کلی
