دستگاه های مولکولی مناسب برای انجام تست HPV

آزمایش ویروس پاپیلومای انسانی (HPV) در آزمایشگاه‌های بالینی به دستگاه‌های PCR نیاز دارد که حساسیت، ویژگی و توان عملیاتی بالایی را ارائه می‌دهند، با توجه به نیاز به شناسایی و تمایز بین انواع مختلف HPV، که برخی از آنها با خطر بالاتر ایجاد سرطان دهانه رحم مرتبط هستند. دستگاه‌های واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) ابزار ضروری برای تشخیص ویروس پاپیلومای انسانی (HPV) هستند که با انواع مختلف سرطان‌ها از جمله سرطان دهانه رحم مرتبط است. هنگام انتخاب یک دستگاه PCR مناسب برای تست HPV، انتخاب اغلب به نیازهای خاص آزمایشگاه از جمله ظرفیت نمونه، حساسیت، ویژگی و بودجه بستگی دارد. در اینجا چند سیستم PCR رایج برای آزمایش HPV آورده شده است:

دستگاه های ریل تایم PCR (Quantitative PCR): این دستگاه‌ها به‌طور گسترده مورد استفاده قرار می‌گیرند زیرا نه تنها می‌توانند وجود DNA HPV را تشخیص دهند، بلکه مقدار آن را نیز تعیین می‌کنند، که برای ارزیابی بار ویروسی بسیار مهم است. مدل های محبوب شامل سیستم PCR Real-Time 7500 Applied Biosystems و سیستم لمسی Bio-Rad CFX96 است. آنها حساسیت و ویژگی بالایی را با زمان های برگشت سریع ارائه می دهند. سیستم های دیجیتال PCR (dPCR): برای حساسیت و دقت بیشتر، می توان از سیستم های دیجیتال PCR استفاده کرد. اینها به ویژه در مواردی که به دقت بالایی نیاز است، مانند تشخیص سطوح پایین ویروس در عفونت‌های اولیه یا در سناریوهای غربالگری، مفید هستند. به عنوان مثال می توان به سیستم PCR دیجیتال قطره ای Bio-Rad QX200 و سیستم PCR دیجیتال سه بعدی QuantStudio اشاره کرد. سیستم های Multiplex PCR: برخی از سیستم ها امکان تشخیص همزمان چندین نوع HPV را در یک واکنش فراهم می کنند. این برای غربالگری موثر است زیرا بسیاری از انواع HPV انکوژن هستند. سیستم‌هایی مانند فناوری XMAP Luminex با استفاده از مهره‌های رنگی که می‌توانند ژنوتیپ‌های HPV مختلف را در یک نمونه متمایز کنند، مالتی پلکس را ممکن می‌سازند.

سیستم‌های PCR خودکار: برای آزمایشگاه‌هایی با حجم نمونه بالا، سیستم‌های خودکاری که آماده‌سازی نمونه، راه‌اندازی و تجزیه و تحلیل PCR را ادغام می‌کنند، می‌توانند به طور قابل‌توجهی توان عملیاتی را افزایش داده و خطر آلودگی را کاهش دهند. Roche cobas 4800 System نمونه ای از یک سیستم خودکار است که می تواند تعداد زیادی نمونه را با کمترین دخالت انسان پردازش کند.
دستگاه های قابل حمل PCR: همچنین دستگاه های کوچکتر و قابل حمل تری برای استفاده در محیط های صحرایی یا در کلینیک هایی که فضا محدود است در دسترس هستند. سیستم GeneXpert توسط Cepheid یک نمونه است که آزمایش سریع در محل را با حداقل تجهیزات ارائه می دهد. هنگام انتخاب دستگاه PCR، انواع خاصی از HPV را که باید تشخیص دهید، حجم مورد انتظار آزمایشات و اینکه آیا یکپارچه سازی با سیستم های اطلاعات آزمایشگاهی موجود مورد نیاز است را در نظر بگیرید. همچنین ارزیابی هزینه‌های جاری، مانند معرف‌ها و تعمیر و نگهداری، و همچنین پشتیبانی فنی ارائه‌شده توسط سازنده، مهم است. دستگاه های ریل تایم PCR زیر برای انجام تست های HPV مناسب هستند:

Qiagen Rotor-Gene Q

حساسیت بالا و تعیین کمیت دقیق، برای تشخیص بارهای ویروسی کم که اغلب در عفونت های HPV وجود دارد مفید است. توانایی تجزیه و تحلیل ذوب با وضوح بالا، که می تواند برای افتراق بین ژنوتیپ های HPV مفید باشد. طراحی چرخشی گریز از مرکز آن توزیع یکنواخت دما را تضمین می کند که برای دقت نتایج PCR بسیار مهم است. این سیستم به دلیل چرخه حرارتی با کارایی بالا و قابلیت‌های تشخیص نوری شناخته شده است. Rotor-Gene Q از یک طراحی چرخشی گریز از مرکز منحصر به فرد برای اطمینان از کنترل دقیق دما و گرمایش و سرمایش سریع و همگن نمونه ها استفاده می کند. سیستم نوری آن برای تشخیص حساس سیگنال‌های فلورسنت در کانال‌های متعدد طراحی شده است که امکان سنجش‌های PCR مالتی پلکس و طیف وسیعی از کاربردها در آنالیز کمی و کیفی را فراهم می‌کند. نرم افزار و یکپارچه سازی: سیستم توسط نرم افزار تخصصی پشتیبانی می شود که گردش کار از آماده سازی نمونه تا تجزیه و تحلیل PCR را مدیریت می کند. این نرم افزار عملیات کاربر پسند، مدیریت داده ها و تجزیه و تحلیل و همچنین یکپارچه سازی با سیستم های اطلاعات آزمایشگاهی (LIS) را امکان پذیر می کند. قابلیت ردیابی، گزارش‌دهی و انطباق با استانداردهای نظارتی را فراهم می‌کند.

Applied Biosystems StepOne Plus

قابلیت های Real-time PCR را با حساسیت و ویژگی خوب ارائه می دهد. مناسب برای توان عملیاتی کم تا متوسط است و برای آزمایشگاه‌های کوچکتر یا کسانی که نیاز به آزمایش HPV متناوب دارند، انتخاب خوبی است. دارای نرم افزار انعطاف پذیر با ابزارهای تحلیلی مختلف که به تفسیر نتایج تست HPV کمک می کند.

Bio-Rad CFX 96

فناوری نوری پیشرفته و کنترل حرارتی دقیق را ارائه می دهد که برای تشخیص و تمایز ژنوتیپ های HPV بسیار مهم است. می توان آن را با سیستم های اتوماسیون با توان بالا ادغام کرد، که آن را به گزینه خوبی برای آزمایشگاه هایی با حجم نمونه بالاتر تبدیل می کند. نرم افزار CFX Maestro از تجزیه و تحلیل داده های پیشرفته پشتیبانی می کند که می تواند شناسایی انواع خاص HPV را تسهیل کند.

Applied Biosystems 7500 (ABI 7500)

به دلیل عملکرد قوی و تطبیق پذیری آن شناخته شده است، می تواند به طور موثر برای تجزیه و تحلیل کیفی و کمی DNA HPV استفاده شود. حساسیت و ویژگی بالایی را ارائه می دهد که برای تشخیص دقیق HPV و تعیین ژنوتیپ ضروری است. این نرم افزار گزینه های تجزیه و تحلیل جامعی را ارائه می دهد که می تواند برای مطالعات و تحقیقات دقیق HPV مفید باشد.

معرفی سایر دستگاه های مناسب و کارایی آن ها:

سیستم Roche Cobas 4800

به طور خاص برای آزمایش HPV با توان بالا، ارائه استخراج خودکار DNA، راه اندازی PCR و تشخیص ریل تایم طراحی شده است. قادر به تشخیص همزمان 14 نوع HPV پرخطر، با ژنوتیپ خاص برای HPV 16 و 18، که انکوژن ترین انواع هستند. حساسیت و ویژگی بالا آن را به یک انتخاب قابل اعتماد برای اهداف غربالگری و تشخیصی در یک محیط بالینی تبدیل می کند. سیستم Roche Cobas 4800 یک پلت فرم کاملاً خودکار و یکپارچه تشخیص مولکولی است که توسط Roche Diagnostics توسعه یافته است. این برای ارائه آزمایش‌های با توان بالا و کارآمد برای طیف گسترده‌ای از سنجش‌های مولکولی در تشخیص بالینی طراحی شده است.
Cobas x 480 Instrument: این واحد آماده سازی نمونه سیستم است. این فرآیند استخراج و تصفیه اسید نوکلئیک را از انواع نمونه‌ها از جمله نمونه‌های خون، بافت و سواب خودکار می‌کند. Cobas x 480 از فناوری ذرات مغناطیسی برای استخراج اسید نوکلئیک استفاده می کند که خلوص و کیفیت بالای اسیدهای نوکلئیک را تضمین می کند. آنالایزر Cobas z 480: این واحد تشخیص PCR در زمان واقعی است. پس از آماده شدن نمونه ها بر روی دستگاه Cobas x 480، برای تقویت و تشخیص PCR به آنالایزر Cobas z 480 منتقل می شوند. Cobas z 480 از فناوری Real-time PCR استفاده می کند که حساسیت و ویژگی بالایی را در تشخیص و تعیین کمیت اسیدهای نوکلئیک ارائه می دهد. به طور خلاصه، سیستم Roche Cobas 4800 یک پلت فرم جامع تشخیص مولکولی است که آماده سازی نمونه خودکار، تجزیه و تحلیل ریل تایم PCR  و یکپارچه سازی نرم افزار پیشرفته را برای ارائه آزمایش دقیق و کارآمد برای انواع کاربردهای بالینی ترکیب می کند.

Qiagen QIAsymphony RGQ

بیشتر بخوانید:مناسب ترین دستگاه های مولکولی جهت انجام تست های جدید ژنتیکی

یک راه حل کامل گردش کار از آماده سازی نمونه تا تشخیص را با ماژول های یکپارچه برای هر مرحله ارائه می دهد. از کیت Artus HPV RG PCR استفاده می کند که برای تشخیص خاص و حساس طیف وسیعی از انواع HPV طراحی شده است. اتوماسیون و ظرفیت توان عملیاتی بالا برای آزمایشگاه هایی با حجم نمونه زیاد ایده آل است.

Qiagen QIAsymphony RGQ یک سیستم آزمایشگاهی پیشرفته است که ترکیبی از قابلیت‌های آماده‌سازی نمونه و ریل تایم PCR است. این برای پردازش خودکار نمونه های بیولوژیکی با توان بالا به منظور استخراج اسید نوکلئیک و تجزیه و تحلیل کمی PCR طراحی شده است. Qiagen QIAsymphony RGQ یک راه حل جامع برای آزمایشگاه هایی است که برای آماده سازی نمونه و آنالیز ریل تایم PCR به قابلیت های کارآمد، قابل اعتماد و با توان بالا نیاز دارند. سیستم Qiagen QIAsymphony RGQ شامل چندین مؤلفه است که با هم کار می کنند تا فرآیند آماده سازی نمونه و تجزیه و تحلیل PCR را خودکار کنند. اجزای اصلی سیستم عبارتند از:
QIAsymphony SP (آماده سازی نمونه): این ماژول استخراج و خالص سازی اسیدهای نوکلئیک را از طیف وسیعی از انواع نمونه به طور خودکار انجام می دهد. از فناوری ذرات مغناطیسی برای پردازش نمونه استفاده می‌کند و می‌تواند حجم نمونه‌های مختلف را مدیریت کند و انعطاف‌پذیری را برای نیازهای آزمایشگاهی مختلف ارائه دهد. ماژول QIAsymphony SP برای بازده و کارایی بالا طراحی شده است و از نتایج استخراج ثابت و قابل تکرار اطمینان حاصل می کند.
QIAsymphony AS (Assay Setup): ماژول Assay Setup مسئول تهیه مخلوط واکنش PCR است. پیپت کردن معرف‌ها، نمونه‌ها و کنترل‌ها در صفحات یا لوله‌های PCR را خودکار می‌کند و احتمال خطای انسانی و آلودگی متقابل را کاهش می‌دهد. این ماژول برای تنظیم دقیق و کارآمد سنجش ها، به ویژه در محیط های با توان بالا، یکپارچه است.

Abbott m2000 RealTime System

سیستم یکپارچه ای که کل فرآیند تست مولکولی، از آماده سازی نمونه گرفته تا تقویت و تشخیص ریل تایم را خودکار می کند. از سنجش HPV RealTime High Risk Abbott استفاده می کند که می تواند 14 نوع HPV پرخطر را شناسایی کند و نتایج فردی را برای HPV 16 و 18 ارائه دهد. حساسیت و ویژگی بالایی را ارائه می دهد که برای ارزیابی و تشخیص دقیق خطر HPV بسیار مهم است.

فاکتورهایی که برای تست HPV باید در نظر گرفت:

قابلیت ژنوتایپینگ: توانایی تمایز انواع پرخطر HPV، به ویژه تیپ های 16 و 18، از انواع دیگر. حساسیت و ویژگی: حساسیت بالا برای شناسایی بارهای ویروسی کم مورد نیاز است، در حالی که ویژگی بالا برای جلوگیری از مثبت کاذب مهم است. توان عملیاتی و اتوماسیون: دستگاه‌هایی با توان عملیاتی و اتوماسیون بالا در تنظیمات بالینی ترجیح داده می‌شوند تا حجم زیادی از نمونه‌ها را به طور کارآمد مدیریت کنند. تأیید نظارتی: دستگاه‌هایی که برای آزمایش HPV استفاده می‌شوند باید تأییدیه‌های نظارتی لازم را داشته باشند و اطمینان حاصل شود که استانداردهای استفاده تشخیصی بالینی را رعایت می‌کنند. این دستگاه‌ها برای تشخیص و تعیین ژنوتیپ HPV با کارایی بالا، دقیق و قابل اعتماد طراحی شده‌اند و آنها را به انتخاب‌های مناسبی برای آزمایشگاه‌های بالینی درگیر در غربالگری و تشخیص HPV روتین تبدیل می‌کند.

برای مطالعه بیشتر به مقاله ذیل مراجعه کنید.

این مقاله به بررسی و مقایسه پنج پلتفرم مولکولی تایید شده توسط FDA برای تشخیص ویروس پاپیلومای انسانی (HPV) می‌پردازد. این پلتفرم‌ها شامل تست‌های مبتنی بر تکنیک‌های مختلفی مانند PCR هستند و هر یک دارای مزایا و محدودیت‌های خاص خود می‌باشند. مطالعه نشان می‌دهد که تست‌های مولکولی برای تشخیص HPV با ریسک بالا، حساسیت بیشتری در شناسایی ضایعات سلولی با ریسک بالا (HSIL/CIN2+) دارند، اما سیتولوژی به دلیل اختصاصیت بیشتر، تکمیل‌کننده این تست‌ها است.

لینک دانلود مقاله

کلام آخر

 دستگاه های ذکر شده به دلیل حساسیت و ویژگی های بسیار خوب شناخته شده اند که برای تشخیص دقیق انواع مختلف HPV بسیار مهم هستند. از جمله آن ها توان عملیاتی و حجم نمونه بالا هستند. CFX 96 و ABI 7500 برای نیازهای توان بالاتر مناسب‌تر هستند، در حالی که StepOne Plus و Rotor-Gene Q برای توان عملیاتی کمتر یا آزمایش‌های کمتر مناسب هستند. اگر ژنوتیپ خاص HPV بخش مهمی از پروتکل آزمایش است، دستگاه‌هایی با تجزیه و تحلیل منحنی ذوب پیشرفته مانند Rotor-Gene Q یا دستگاه‌هایی با قابلیت‌های مالتی پلکس قوی مانند CFX 96 و ABI 7500 باید در نظر گرفته شوند. به طور خلاصه، بهترین دستگاه PCR برای تست HPV به نیازهای خاص آزمایشگاه از جمله حجم آزمایشات، نیاز به ژنوتایپینگ HPV و زیرساخت آزمایشگاهی موجود بستگی دارد. هر یک از دستگاه های ذکر شده دارای نقاط قوتی است که آن را برای جنبه های خاصی از تست HPV مناسب می کند. جهت دریافت مشاوره و راه اندازی پنل HPV با کارشناسان ما در ماناتک تماس حاصل فرمایید.