ستونهای استخراج (Spin Columns)
ستونهای استخراج در آزمایشگاه های مولکولی برای جداسازی و خالص سازی اسیدهای نوکلئیک مانند DNA و RNA استفاده میشوند. این ستونها معمولاً حاوی یک غشای سیلیکونی هستند که به اتصال و جداسازی اسیدهای نوکلئیک کمک میکند. روشهای مختلفی برای استخراج وجود دارد، از جمله تخلیص ستونی، رسوبی، و استفاده از دانه های مغناطیسی.
در روش تخلیص ستونی، نمونه ها ابتدا تحت فرآیندهای لیز سلولی قرار میگیرند تا DNA یا RNA آزاد شود. سپس، این مولکولها به ستون اضافه شده و به دلیل ویژگیهای شیمیایی غشای سیلیکونی، اسیدهای نوکلئیک به آن متصل میشوند. پس از شستشوی ناخالصیها، اسید نوکلئیک خالص میتواند از ستون جدا شود.
روشهای دیگر مانند استفاده از دانه های مغناطیسی نیز وجود دارد که در آن اسیدهای نوکلئیک به دانه های مغناطیسی متصل شده و با استفاده از یک میدان مغناطیسی جدا میشوند این فرآیندها امکان تحقیقات ژنتیکی و بیومولکولی را فراهم میآورند و در تشخیص بیماریها، تحقیقات پزشکی، و بیوتکنولوژی کاربردهای گستردهای دارند.
ستونهای استخراج DNA و RNA جزء اصلی بسیاری از پروتکل‌های تخلیص اسید نوکلئیک هستند. این ستونها شامل یک ماتریس یا غشاء مبتنی بر سیلیکا هستند که در حضور غلظت‌های بالای نمک، اسیدهای نوکلئیک را متصل میکند، امکان جداسازی اسیدهای نوکلئیک از سایر مؤلفه‌های سلولی را فراهم میکند. در اینجا مروری بر انواع ستونهای مورد استفاده برای استخراج DNA و RNA ارائه شده است:
ستونهای استخراج DNA:
ستونهای استخراج DNA پلاسمید:
این ستونها به طور خاص برای تخلیص DNA پلاسمید از فرهنگ‌های باکتریایی طراحی شده‌اند. آن‌ها اغلب در اندازه‌های مینی، میدی و ماکسی می‌آیند، اشاره به مقدار فرهنگ باکتریایی اولیه و عائد DNA پلاسمید دارند.
ستونهای استخراج DNA ژنومی:
برای استخراج DNA ژنومی از منابع مختلف مانند خون، بافت، گیاهان و میکروبها استفاده میشوند. آن‌ها برای مدیریت اندازه و پیچیدگی بیشتر DNA ژنومی طراحی شده‌اند.
ستونهای تمیزکاری PCR:
پس از واکنش PCR، از این ستونها برای تخلیص DNA تکثیر شده از پرایمرها، نوکلئوتیدها، آنزیم‌ها و سایر آلودگی‌ها استفاده میشود.
ستونهای استخراج ژل:
اگر DNA با الکتروفورز ژل آگاروز جدا شده و نیاز به تخلیص از ژل دارد، از این ستونها استفاده میشود. آن‌ها امکان بازیابی قطعات DNA از قطعات ژل را فراهم میکنند.
ستونهای استخراج RNA:
ستونهای استخراج RNA total:
این ستونها برای استخراج تمام گونه‌های RNA از نمونه طراحی شده‌اند، از جمله mRNA، rRNA، tRNA و RNAهای کوچک.
ستونهای استخراج mRNA:
به طور خاص برای جداسازی فقط فراکسیون mRNA از RNA کلی طراحی شده‌اند. آن‌ها اغلب از غشاء‌های oligo(dT) برای اتصال دماغه poly-A مولکول‌های mRNA استفاده میکنند.
ستونهای استخراج RNA کوچک:
این ستونها برای بازیابی گونه‌های RNA کوچک، مانند miRNA و siRNA، که می‌توانند در پروتکل‌های استخراج RNA استاندارد از دست بروند، بهینه‌سازی شده‌اند.
ستونهای استخراج RNA ویروسی:
برای استخراج RNA از ویروس‌ها در نمونه‌های بالینی یا تحقیقاتی استفاده میشوند. آن‌ها برای مدیریت مقادیر اغلب کم RNA ویروسی بهینه‌سازی شده‌اند.
ویژگیهای مشترک ستونهای استخراج:
غشاء یا ماتریس سیلیکا: مؤلفه مرکزی که اسیدهای نوکلئیک را در حضور نمک‌های chaotropic متصل میکند.
لازم به ذکر است که در حالی که ستونها روش محبوبی برای استخراج اسید نوکلئیک هستند، روشهای دیگری نیز موجود است، مانند استخراج‌های مبتنی بر مهره‌های مغناطیسی. انتخاب روش اغلب بستگی به نیازهای خاص برنامه‌های دنباله‌دار، نوع نمونه و عائد و خلوص مورد نظر اسید نوکلئیک دارد.
ستون استخراج 12 لایه قرمز
- این ستون دارای 12 لایه فیلتر (سیلیکا) HIGH Quality است.
- این ستون بسته 50 عددی حاوی 50 ستون و 50 کالکشن تیوب عرضه می شود.
- این ستون مناسب برای استخراج DNA/RNA ( RNA High Pure) و cfDNA است.
- دارای تاریخ انقضای بالا است.
سلولهای آزاد DNA یا cfDNA، قطعات کوچک DNA هستند که در مایعات بدن مانند پلاسمای خون، ادرار، و مایع مغزی-نخاعی یافت میشوند.
این قطعات DNA معمولاً از فرآیندهایی مانند آپوپتوز (برنامه ریزی مرگ سلولی)، نکروز (مرگ غیربرنامه ریزی شده سلولی)، و NETosis (یک فرآیند دفاعی که در آن نوتروفیل ها شبکه هایی از DNA را برای گرفتن میکروبها منتشر میکنند) آزاد میشوند.
سطوح بالای cfDNA در بیماریهایی مانند سرطان، به ویژه در مراحل پیشرفته، مشاهده شده است.
به عنوان یک نشانگر بیولوژیکی مفید برای تشخیص و پیگیری بیماریهای مختلف مانند سرطان، ضربه، سپسیس، حمله قلبی، سکته، پیوند، دیابت، و بیماری داسیشکل شناخته شده است.
cfDNA میتواند به عنوان یک ابزار تشخیصی مهم در پزشکی مولکولی و بیومارکر برای پیگیری درمانهای سرطانی مورد استفاده قرار گیرد. به عنوان مثال، تجزیه و تحلیل cfDNA میتواند برای شناسایی جهش های مرتبط با تومور در بیماران مبتلا به سرطان استفاده شود.
cfDNA در ژنتیک به چه صورت استفاده میشود؟
استفاده از cfDNA در ژنتیک شامل چندین کاربرد مهم است:
1. غربالگری قبل از تولد (NIPT): cfDNA میتواند برای تشخیص غیرتهاجمی ناهنجاریهای کروموزومی در جنین استفاده شود، مانند سندرم داون (تریزومی ۲۱)، تریزومی ۱۸ و تریزومی.
2. تشخیص سرطان: cfDNA حاوی جهشهای مرتبط با تومور (ctDNA) میتواند برای تشخیص و نظارت بر سرطانها استفاده شود.
3. نظارت بر پیوند: cfDNA میتواند برای نظارت بر پیوندهای اعضا استفاده شود تا رد پیوند یا عملکرد اندام پیوندی را تشخیص دهد.
4. تشخیص بیماریهای عفونی: cfDNA میتواند برای تشخیص عفونت ها و بیماریهای عفونی استفاده شود.
5. ارزیابی خطر بیماریهای قلبی عروقی: cfDNA میتواند در ارزیابی خطر بیماریهای قلبی عروقی به کار رود.
6. بیماریهای خود ایمنی: cfDNA میتواند در تشخیص و نظارت بر بیماریهای خود ایمنی مفید باشد.
7. تحلیل پزشکی قانونی: cfDNA در تحقیقات پزشکی قانونی برای شناسایی افراد یا تعیین علت مرگ به کار میرود.
8. تحقیق و کشف نشانگر زیستی: cfDNA میتواند در تحقیقات برای کشف نشانگرهای زیستی جدید استفاده شود.
این کاربردها نشان میدهند که cfDNA چگونه میتواند به عنوان ابزاری قدرتمند در ژنتیک و پزشکی مولکولی عمل کند.
کلام آخر:
رنگ رینگ ها در داخل ستون ها به صورت قراردادی بوده و ثابت نمی باشد. این رینگ در شرکت های مختلف متفاوت می باشد، اگر به دنبال مورد خاصی از ستون ها میباشید، باید در ویژگی های ستون های شرکت های مختلف جستجو کنید و نه به دنبال رنگ ها باشید. برای دریافت اطلاعات تخصصی میتوانید با کارشناسان ما در ماناتک تماس حاصل فرمایید.
نقد و بررسی‌ها
هنوز بررسی‌ای ثبت نشده است.