سیستم‌های StepOne™ هر دو مجهز به شیمی‌های تشخیص فلوروفور هستند که شامل آزمایش‌های بر پایه پروب TaqMan® با برچسب‌گذاری رنگ‌های FAM™ و VIC®، آزمایش‌های بر پایه پروب با برچسب‌گذاری رنگ‌های VIC® و TAMRA™ و شیمی رنگ SYBR® Green I می‌باشند. [توجه: رنگ TAMRA™ فقط با سیستم StepOnePlus™ موجود است.] آزمایش‌های بر پایه پروب TaqMan® دقت و حساسیت برجسته‌ای ارائه می‌دهند و شیمی رنگ SYBR® Green I یک جایگزین اقتصادی برای شناسایی هدف، آزمایش‌های غربالگری اولیه، یا آزمایش‌هایی است که فقط به چند واکنش نیاز دارند.

تحلیل نرم‌افزاری (شکل‌های 7 و 8):

نرم‌افزار سیستم‌های StepOne™ از تنوعی از روش‌های تحلیل پشتیبانی می‌کند، از جمله:

• کمی‌سازی مطلق
  • منحنی استاندارد
• کمی‌سازی نسبی
  • منحنی استاندارد نسبی
  • Ct مقایسه‌ای (ΔΔCt)
• آزمایش‌های حضور/غیاب (مثبت/منفی) با کنترل مثبت داخلی
• تجزیه و تحلیل منحنی ذوب
• ژنوتایپ‌کردن (شامل تکثیر زمان واقعی)
• تحلیل ذوب با وضوح بالا (نیازمند بسته نرم‌افزاری اضافی)

کاربردها:

سیستم‌های StepOne™ از هر نوع کاربرد PCR زمان واقعی پشتیبانی می‌کنند. آزمایش‌های طراحی‌شده قبلی یا سفارشی برای کاربردهای زیر وجود دارند:

• ژنوتایپ‌کردن SNP
• تجزیه و تحلیل انتقالات
• پروفایل‌سازی بیان ژن
• تشخیص ژن
• بیان MicroRNA
• تجزیه و تحلیل بار ویروسی
• متیلاسیون
• اسکن تغییرات

سرعت:

سیستم‌های StepOne™ و StepOnePlus™ هر دو چرخه‌های حرارتی استاندارد و سریع را روی همان بلوک بدون نیاز به تغییر انجام می‌دهند. چرخه حرارتی استاندارد کمتر از 2 ساعت زمان نیاز دارد، و چرخه حرارتی سریع زمان اجرای کاربردهای PCR زمان واقعی کمیتی را به طور قابل توجهی کاهش می‌دهد و نتایج را در 40 دقیقه ارائه می‌دهد. چرخه سریع ایده‌آل برای حداکثر کردن تعداد اجراها در یک دستگاه در هر روز کاری است.

دستگاه StepOne™ Real-Time PCR System از شرکت Applied Biosystems برای تشخیص و تجزیه و تحلیل ژنتیکی در بسیاری از زمینه‌های بیماری‌ها مورد استفاده قرار می‌گیرد. به دلیل قابلیت دقیق و سریع این تکنولوژی در تشخیص مولکولی، این دستگاه در تشخیص بیماری‌های زیر کاربرد دارد:

1. بیماری‌های عفونی: RT-PCR می‌تواند برای تشخیص ویروس‌ها و باکتری‌ها استفاده شود. برای مثال، در طی همه‌گیری COVID-19، این تکنولوژی به طور گسترده‌ای برای تشخیص SARS-CoV-2 استفاده شد. همچنین در تشخیص دیگر عفونت‌های ویروسی مانند HIV، اینفلوآنزا و هپاتیت و باکتریایی مانند توبرکولوز و کلامیدیا کاربرد دارد.
2. سرطان‌ها: RT-PCR اغلب برای تشخیص بیان ژن‌های خاصی که می‌توانند در تومورها یا سلول‌ های سرطانی دیده شوند، استفاده می‌شود. این تکنیک می‌تواند به شناسایی سرطان‌هایی مانند سرطان پروستات، سینه، ریه و دیگر انواع سرطان کمک کند.
3. بیماری‌های ژنتیکی: RT-PCR در تشخیص بیماری‌های ژنتیکی نظیر دیستروفی عضلانی، فیبروز کیستیک، و بیماری‌های متابولیک مورد استفاده قرار می‌گیرد. این روش می‌تواند موتاسیون‌ها یا نواقص ژنتیکی را که ممکن است منجر به بیماری شوند، شناسایی کند.
4. بیماری‌های اتوایمیون و التهابی: این دستگاه همچنین می‌تواند برای مطالعه بیماری‌هایی مانند روماتیسم مفصلی و سایر اختلالات التهابی که در آنها بیان ژن‌های خاصی افزایش می‌یابد، استفاده شود.

استفاده از RT-PCR در تشخیص پزشکی به دلیل دقت بالا، حساسیت بیشتر نسبت به روش‌های دیگر و قابلیت انجام سریع آزمایش، بسیار محبوب است. این دستگاه به پزشکان و محققان امکان می‌دهد تا به سرعت و با دقت بالا درمورد بیماری‌ های مختلف تشخیص و تصمیم‌ گیری کنند.

دستگاه StepOne Real-Time PCR System از شرکت Applied Biosystems (ABI) یکی از سیستم‌های برجسته در زمینه PCR در زمان واقعی است که به خاطر ویژگی‌های خاص و کاربرپسند خود، تفاوت‌های واضحی با سایر دستگاه‌های ریل تایم PCR دارد. یکی از تفاوت‌های اصلی StepOne با دستگاه‌های ریل تایم PCR دیگر، سیستم Real-Time آن است که به کاربران امکان می‌دهد تا داده‌ها را در حین انجام واکنش PCR جمع‌آوری و تحلیل کنند. این ویژگی به آنها این امکان را می‌دهد که فرآیند واکنش را به‌طور همزمان نظارت کرده و نتایج را به صورت آنی دریافت کنند.

علاوه بر این، StepOne دارای صفحه نمایش LCD و رابط کاربری ساده‌ای است که فرآیند تنظیم و اجرای پروتکل‌های PCR را بسیار آسان می‌کند. این رابط کاربری به‌ویژه برای کاربران تازه‌کار مفید است و به سرعت به آن‌ها کمک می‌کند تا دستگاه را به‌راحتی راه‌اندازی و استفاده کنند. همچنین، این دستگاه امکان اتصال به رایانه از طریق پورت USB را فراهم می‌آورد، که به کاربران این امکان را می‌دهد تا داده‌ها را ذخیره و تجزیه و تحلیل کنند و پروتکل‌های PCR را به سادگی تنظیم کنند.

در مقایسه با دستگاه‌های دیگر از شرکت ABI، مانند QuantStudio® 3 و QuantStudio® 5، StepOne معمولاً دارای تعداد کمتری از کانال‌های رنگی است. دستگاه‌های QuantStudio® به طور معمول با تعداد بیشتری از کانال‌های رنگی و قابلیت‌های تحلیل داده پیشرفته‌تر عرضه می‌شوند که امکان تحلیل چندین هدف ژنتیکی به طور همزمان را فراهم می‌آورد. این دستگاه‌ها همچنین با نرم‌افزارهای تحلیل داده پیشرفته‌تری همراه هستند که تحلیل‌های پیچیده‌تر و دقیق‌تری را ممکن می‌سازند. از نظر انعطاف‌پذیری در پروتکل‌ها و کنترل‌های حرارتی، دستگاه‌های QuantStudio® معمولاً قابلیت‌های بیشتری دارند و برای کاربردهای تخصصی‌تر مناسب‌تر هستند.

در مقایسه با دستگاه‌های PCR دیگر از سایر شرکت‌ها، مانند Bio-Rad CFX96، StepOne ممکن است در زمینه تعداد کانال‌های رنگی و امکانات تحلیل داده محدودتر باشد. CFX96 از Bio-Rad دارای سیستم‌های پیشرفته‌تری برای کنترل دما و تعداد بیشتری از کانال‌های رنگی است که امکان انجام تحلیل‌های پیچیده‌تری را فراهم می‌آورد. همچنین، دستگاه‌های Thermo Fisher Scientific، مانند PikoReal, با قابلیت‌های پیشرفته‌تری در تحلیل داده‌ها و کنترل دما عرضه می‌شوند. این دستگاه‌ها ممکن است قابلیت‌های بیشتری نسبت به StepOne در زمینه تحلیل داده‌ها و تنظیم پروتکل‌ها داشته باشند.

در نهایت، دستگاه StepOne Real-Time PCR System به دلیل طراحی کاربرپسند، قابلیت‌های Real-Time، و قیمت مناسب‌تر، برای آزمایشگاه‌هایی که نیاز به یک سیستم PCR با عملکرد استاندارد و قابل اطمینان دارند، مناسب است. در حالی که دستگاه‌های پیشرفته‌تر از دیگر شرکت‌ها و مدل‌های دیگر ABI ممکن است ویژگی‌های اضافی و قابلیت‌های پیشرفته‌تری ارائه دهند، StepOne با توجه به طراحی ساده و کاربردی خود، انتخاب مناسبی برای بسیاری از کاربردهای عمومی و استاندارد است.