سیستمهای Ion Proton و Ion S5 هر دو پلتفرمهای توالییابی نسل بعدی (NGS) توسعه یافته توسط Thermo Fisher Scientific هستند، اما دارای ویژگیهای متمایز و طراحی شده برای نیازهای متفاوت از نظر کارایی هستند. درک تفاوتهای بین این دو سیستم میتواند در انتخاب پلتفرم مناسب برای نیازهای خاص تحقیقات ژنومی کمک کند. در اینجا مقایسهای از جنبههای کلیدی ارائه شده است:
فناوری توالییابی:
- هر دو سیستم از فناوری توالییابی نیمهرسانا استفاده میکنند که یونهای هیدروژن آزاد شده در طی فرآیند پلیمریزاسیون DNA را تشخیص میدهند. با این حال، ممکن است در جزئیات تشخیص و قابلیتهای پردازش آنها تفاوتهایی وجود داشته باشد.
کارایی و قابلیت ارتقاء:
- سیستم Ion Proton: برای توالییابی با کارایی متوسط تا بالا طراحی شده است. این سیستم به ویژه برای توالییابی کامل ژنوم و اگزوم مناسب است و برای کاربردهایی که به خروجی بالاتری نیاز دارند مانند مطالعات ژنومیک مقیاس بزرگ یا تحقیقات بالینی ایدهآل است.
- سیستم Ion S5: قابلیت انعطافپذیری بیشتری از نظر کارایی ارائه میدهد، با چیپ های مختلف که به نیازهای متفاوت پروژهها پاسخ میدهند. این سیستم چندمنظوره است و میتواند همه چیز از پانلهای هدفمند کوچک تا توالییابی اگزوم را پوشش دهد و برای پروژههای کوچک و بزرگ مناسب است.
سرعت توالییابی:
- هر دو سیستم قابلیت توالییابی سریع را ارائه میدهند، اما سیستم Ion Proton به طور کلی در انجام وظایف توالییابی کامل ژنوم و اگزوم سریعتر است. سیستم Ion S5، در حالی که همچنین کارآمد است، ممکن است زمانهای اجرای متفاوتی داشته باشد که بستگی به چیپ استفاده شده و پیچیدگی پروژه دارد.
کاربردها:
- سیستم Ion Proton: بیشتر بر توالییابی کامل ژنوم و اگزوم تمرکز دارد.
- سیستم Ion S5: برای طیف گستردهای از نیازهای توالییابی مناسب است، از جمله توالییابی DNA هدفمند، RNA و توالییابی ژنومهای کوچک.
خروجی داده:
- سیستم Ion Proton معمولاً خروجی داده بیشتری در هر اجرا تولید میکند در مقایسه با سیستم Ion S5، که با مناسب بودن آن برای پروژههای ژنومیک بزرگتر همخوانی دارد.
رابط کاربری و نرمافزار:
- هر دو سیستم مجهز به رابطهای کاربری و نرمافزارهای دوستانه برای تجزیه و تحلیل دادهها هستند. با این حال، ویژگیهای خاص و تجربه کاربری ممکن است متفاوت باشد و متناسب با قابلیتهای منحصر به فرد هر سیستم طراحی شده باشد.
هزینه:
- هزینه کلی هر سیستم ممکن است بر اساس نیازها و کارایی و مقیاس پروژهها متفاوت باشد. قابلیت انعطافپذیری سیستم Ion S5 ممکن است راهحلهای مقرونبهصرفهتری برای پروژههای کوچک یا متوسط ارائه دهد، در حالی که سیستم Ion Proton به دلیل کارایی بالاتر ممکن است برای پروژههای مقیاس بزرگتر مقرونبهصرفهتر باشد.
فضای آزمایشگاه:
- هر دو سیستم به گونهای طراحی شدهاند که در فضاهای استاندارد آزمایشگاهی جای بگیرند، اما راهاندازی و نیازهای فضایی آنها ممکن است بسته به تجهیزات جانبی مورد نیاز برای هر سیستم کمی متفاوت باشد.
بیشتر بخوانید:Gene sequence in future/توالی یابی ژن در آینده ای نچندان دور
کلام آخر:
به طور خلاصه، هر دو سیستم Ion Proton و Ion S5 پلتفرمهای پیشرفته NGS هستند که از فناوری نیمهرسانا استفاده میکنند، آنها به مقیاسها و انواع مختلف تحقیقات ژنومیک خدمت میکنند. سیستم Ion Proton بیشتر برای نیازهای کارایی بالاتر مانند توالییابی کامل ژنوم و اگزوم مناسب است، در حالی که سیستم Ion S5 انعطافپذیری و قابلیت انطباقپذیری بیشتری ارائه میدهد که آن را برای طیف گستردهای از پروژههای توالییابی، از جمله مطالعات هدفمند کوچکتر، مناسب میسازد.
برای طلاعات بیشتر در مورد دستگاه و نحوه خرید آن با کارشناسان ما در شرکت ماناتک در تماس باشید.
عالیی✌️